About: The structure and expression of ribosomal RNA genes in invasive Spartina anglica allopolyploid species that formed recently in Europe

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The structure and expression of ribosomal RNA genes in invasive Spartina anglica allopolyploid species that formed recently in Europe Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Cílem projektu je studium struktury a exprese genů pro ribozomální RNA v přirozených populacích invazivního travního druhu Spartina anglica. 1. Genetické aspekty studia. V této části se budeme věnovat otázkám genetických interakcí, rekombinací a homogenizací rodičovských genů rRNA. Bude uskutečněna genetická analýza populací pocházejících z různých lokalit francouzského a britského pobřeží (viz. obr. 1). Budeme řešit otázku, zda genetické změny v lokus rDNA (pokud budou zaznamenány) jsou vyvolané mezidruhovou hybridizací nebo následnou polyploidií. Experimentální systém sterilního hybridu S. townsendii a z něj derivované S. anglica, jako jediný na světě, umožňuje poskytnout odpověď na tuto otázku. 2. Epigenetické aspekty. V této části se budeme zabývat problematikou epigenetického umlčování exprese rodičovských genů rRNA v různých populacích S. anglica a S. townsendii. Budeme řešit otázky, zda fenomén nukleolární dominance (též transkripční umlčování genové exprese) je zákonitý nebo stochastický, zda je ovlivňován populační dynamikou, duplikací chromosomových sad eventuelně genovými přestavbami v průběhu polyploidie a zda existuje korelace mezi umlčováním a metylací DNA. (cs) At the heart of the proposed work is the study of rRNA genes evolution and their expression activity in natural populations of S. anglica. The rationale is that this system allow us to investigate evolutionary processes operating over time scales that are not amenable to laboratory study. They each make use of hybridisation occurring in the wild as naturally occurring experimental manipulations. In the proposed project we ask the following questions: 1. The genetic aspects of rDNA evolution in Spartina anglica. Specifically we will address the question of genetic interaction and homogenisation of parental genes in different populations collected at various places of French and British coasts. We will ask whether the changes (if occurring) are triggered by interspecific hybridization or chromosome duplication. This hypothesis could be tested analyzing populations of sterile T. x townsendii hybrid and parental accessions S. maritima and S.arterniflora. 2. The epigenetic aspects of rDNA evolution in Spartina anglica. Specifically we will address the question of epigenetic silencing of parental rDNA units among populations of F1 hybrids and derived dodecaploids. We wonder whether the expression changes could be correlated with changes in cytosine methylation levels of homeologous units. (en)
Title	Struktura a exprese genů pro ribosomálních RNA v přirozených populacích alopolyploidní Spartina anglica jako významného evropského rostlinného invazivního druhu. (cs) The structure and expression of ribosomal RNA genes in invasive Spartina anglica allopolyploid species that formed recently in Europe (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/5727/2011-320
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/BO
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/M2
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/54609259
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EB
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EH
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/ME
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	Invasive species; allopolyploid; rDNA; evolution; genome (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2012-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/MSM
http://linked.open...avai/start-reseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	128 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	128 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	0 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2011/MEB021114/ico-68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2012/MEB021114/ico-68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2013/MEB021114/ico-68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software