| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Mitochondria accommodate a number of key metabolic pathways. Mitochondrial dysfunction is recognised as an important determinant of a variety of human pathologies, ranging from oxidative phosphorylation disorders to common complex diseases. The mammalian mitochondrial proteome is uniquely encoded by two genomes – nuclear and mitochondrial (mtDNA). While mtDNA encodes only 13 proteins, it is estimated that another ~1,500 nuclear (mitonuclear) genes code for mitochondrial proteins. So far only ~1,100 proteins have clearly ascribed mitochondrial localisation but ~300 of them have no known function and the functions of another ~300 are based only on sequence similarity. This proposal is designed as the first systematic effort to genetically dissect the role of mitochondrial proteins in the pathogenesis of mitochondrial dysfunction and cardiometabolic disorders in the most widely used animal model of metabolic syndrome, the spontaneously hypertensive rat (SHR). This will be accomplished by large scale genetic and network analyses of the mitochondrial proteome and the mitonuclear and mtDNA transcriptomes together with mitochondrial function phenotypes and cardiometabolic traits in recombinant inbred (RI) strains derived from the SHR and the normotensive Brown Norway (BN-Lx) rat. These studies will identify high priority candidate gene variants involved in the regulation of both mitochondrial function and disease related phenotypes. Variants of mitonuclear genes prioritised by the above mentioned analyses will be directly tested by in vivo functional studies using transposon-based transgenesis or zinc finger nuclease knock out techniques as appropriate. Proposed studies will enable the identification of genetic determinants of the mitochondrial proteome in relation to important complex disease traits in the rat and thereby improve understanding the role of mitochondria in pathogenesis of common clinical disorders. (en)
- Mitochondriální dysfunkce podmiňují u lidí mnoho patologických stavů, včetně běžných komplexně podmíněných chorob. Savčí mitochondriální proteom je kódovaný dvěma genomy – jaderným a mitochondriálním (mtDNA). Zatímco mtDNA kóduje pouze 13 proteinů, bylo odhadnuto, že dalších asi 1500 mitochondriálních proteinů je kódováno jadernými geny. V mitochondriích bylo zatím lokalizováno asi jen 1100 proteinů, přičemž funkce přibližně 300 z nich není známá a funkce dalších 300 proteinů je pouze odhadnuta na základě podobnosti jejich sekvence s jinými proteiny. Navrhovaný projekt představuje vůbec první systematickou studii s cílem odhalit pomocí genetických analýz úlohu mitochondriálních proteinů v patogenezi mitochondriálních dysfunkcí, kardiovaskulárních a metabolických poruch u spontánně hypertenzních potkanů kmene SHR – nejčastěji používaného zvířecího modelu metabolického syndromu. Tohoto cíle bude dosaženo rozsáhlými genetickými a korelačními (network) analýzami mitochondriálního proteomu a mitonukleárního a mtDNA transkriptomu společně s mitochondriálními fenotypy a hemodynamickými a metabolickými znaky u rekombinantních inbredních kmenů, odvozených od kmenů SHR a Brown Norway (BN-Lx). Pomocí těchto studií budou odhaleny kandidátní geny regulující jak mitochondriální funkce, tak patofyziologické znaky. Tyto kandidátní geny budou testovány pomocí in vivo funkčních studií buď transgenozí s využitím vysoce efektívních transpozonových konstruktů nebo dle potřeby zrušením funkce genů s využitím ZFN (zinc finger nuclease), případně TALEN (Transcription Activator-Like Effector Nucleases) technik. Tyto analýzy umožní odhalit genetické determinanty mitochondriálního proteomu a jejich úlohu v patogenezi komplexních metabolických poruch u potkana a tím přispějí k lepšímu pochopení účasti mitochondrií v patogenezi běžných klinických poruch. (cs)
|
| Title
| - Genetic analysis of mitochondrial proteome: Integration of mitochondrial-nuclear epistasis with disease phenotypes in the rat (en)
- Genetická analýza mitochondriálního proteomu: Integrace mitochondriální-jaderné epistáze s patofyziologickými fenotypy u potkana (cs)
|
| http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
| |
| http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...avai/druh-souteze
| |
| http://linked.open...domain/vavai/faze
| |
| http://linked.open...vavai/hlavni-obor
| |
| http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...vavai/id-aktivity
| |
| http://linked.open.../vavai/id-souteze
| |
| http://linked.open...n/vavai/kategorie
| |
| http://linked.open...vai/klicova-slova
| - mitochondrial proteome; genetic analysis; network analysis; recombinant inbred strains; spontaneously hypertensive rat; SILAC (en)
|
| http://linked.open...avai/konec-reseni
| |
| http://linked.open...nujicich-prijemcu
| |
| http://linked.open...avai/poskytovatel
| |
| http://linked.open...avai/start-reseni
| |
| http://linked.open...ai/statni-podpora
| |
| http://linked.open...vavai/typProjektu
| |
| http://linked.open...ai/uznane-naklady
| |
| http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
| |
| http://linked.open...cet-spoluprijemcu
| |
| http://linked.open...ai/pocet-vysledku
| |
| http://linked.open...ku-zverejnovanych
| |
| is http://linked.open...ain/vavai/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)