A) Adaptace ROA metodologie pro biologicky relevantní peptidy (2011-2014) B) Optimalizace měření ve vodných i nevodných roztocích (2011-2012) C) Zavedení teplotních měření, konstrukce teplotní cely (2011-2013, podle průběžných výsledků), rozšíření dostupného teplotního rozsahu, dlouhodobé testování cely a její příprava ke komerčnímu využití. D) Syntéza 20 sekvencí systematicky mapující myší prion (2011, základní předpoklad pro spektroskopické experimenty) E) Příprava sirných analogů DNA (2012-2014) F) Syntéza a měření isotopicky značených vybraných peptidů (2012-2014) G) Výpočetní protokoly pro dynamické systémy – kombinované klasické a kvantové studie (2013) F) Výpočetní protokol pro anharmonické korekce vibračních energií (2014) (cs)
Understanding of the structure and behavior of molecules is important for many technical and biochemical applications. Biologically interesting molecules are therefore studied by spectroscopic methods to get information about living processes, to develop new drugs, etc. In this project, the main target is to improve experimental protocols and instrumental setup, primarily for methods using molecular chirality. Specific objectives include 1) Adapt ROA methodology for biologically relevant peptide samples 2) Optimize measurement in aqueous and organic solvents 3) Introduction of temperature- and pressure-controlled experiments 4) Synthesis of 20 sequences mapping the mouse prion protein 5) Synthesis and measurement of selected isotopically-labeled peptides 6) Synthesis and characterization of sulfur-DNA analogues 7) Computational protocols for spectra simulation of dynamic systems 8) Computational protocol for anharmonic corrections to vibrational spectra (en)