About: The study of molecular mechanisms of bacterial adaptation to environmental changes using proteomic techniques

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The study of molecular mechanisms of bacterial adaptation to environmental changes using proteomic techniques Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Podstatou projektu je zejména posouzení vlivu tří známých regulačních proteinů na proteom bakterie Paracoccus denitrificans v procesech adaptace na změny vnějšího prostředí. Je známo, že tyto proteiny působí jako senzory pro kyslík a dusíkaté terminální akceptory elektronů. Po vytvoření databáze k identifikaci proteinů na základě nedávno zpřístupněné genomové sekvence bakterie bude provedena podrobná proteomová studie, srovnávající vliv mutací genů pro regulační proteiny na expresi ostatních proteinů v celobuněčných lyzátech. Proteiny budou separovány dvourozměrnou gelovou elektroforézou a identifikovány hmotnostní spektrometrií. Proteiny se změnami v expresi budou dále podrobeny bioinformatické analýze, u vybraných proteinů budou doplněny funkční analýzy (stanovení enzymových aktivit a hladin mRNA). Ke komplementárnímu srovnání proteinového složení membránových frakcí bude vybrána a testována nová metoda na bázi kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Vytvořená databáze přeloženého (cs) The goal of this study is to explore the effects of three known regulation proteins on Paracoccus denitrificans proteome during adaptation to changed environmental conditions. It is known that these proteins serve as sensors for oxygen and nitrogenous terminal electron acceptors. After construction of the sequence database for mass spectrometry protein identification based on published P. denitrificans genome sequence, a detailed complex proteomic analysis will be performed. The effects of mutation ingenes for regulation proteins on the expression of other proteins in total cell lysates will be examined. The proteins will be separated by two-dimensional gel electrophoresis and identified by mass spectrometry. The proteins with changed expression willbe analyzed by bioinformatic tools; the functional analyses will be performed for selected proteins. A new chromatographic/mass spectrometric method will be tested for a comparison of membrane fractions protein composition. A created sequence database (en)
Title	Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik (cs) The study of molecular mechanisms of bacterial adaptation to environmental changes using proteomic techniques (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/203/07/P471
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/36876613
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/CE
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/GP
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SGA02007GA1PD
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	proteomic analysis; bacterial adaptation; molecular mechanisms; Paracoccus denitrificans (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/GA0
http://linked.open...avai/start-reseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	1431 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	1431 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	6 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	6 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2007/GP203/07/P471/orjk-14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2008/GP203/07/P471/orjk-14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2009/GP203/07/P471/ico-00216224 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2009/GP203/07/P471/orjk-14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2010/GP203/07/P471/ico-00216224

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software