Projekt je zaměřen na poznání regulačních funkcí účastnících se odpovědi na stresové podmínky u bakteriálního producenta aminokyselin Corynebacterium glutamicum. Hlavním cílem projektu je charakterizace oblastí DNA (promotorů a operátorů), které regulujítranskripci vybraných genů účastnících se odpovědi na různé stresové faktory a objasnění příslušných regulačních mechanismů. Práce bude zaměřena zejména na geny kódující alternativní sigma faktory RNA polymerasy (sigE, sigH), příslušné anti-sigma faktorya geny kódující regulační proteiny účastnící se stresové odpovědi. Genetické postupy používané v naší laboratoři by měly přinést výsledky komplementární k výsledkům získaným spolupracujícím korejským týmem, který se bude zabývat studiem proteinů. Bude studováno též regulační působení malé nepřekládané RNA objevené v naší laboratoři, která je dalším elementem účastnícím se odpovědi na stresové faktory, na expresi genu kódujícího transkripční regulátor typu GntR. Získané znalosti budou sloužit jako (cs)
The project is focused on uncovering the regulatory functions involved in stress response of amino acid-producing bacterium Corynebacterium glutamicum. The main aim of the project is to characterize DNA regions (promoters and operators) controlling transcription of the selected genes involved in response to various external stress factors and to elucidate the corresponding regulatory mechanisms. The work will be concentrated especially on genes coding for alternative sigma factors of RNA polymerase(sigE, sigH) and the respective anti-sigma factors and on genes coding for regulatory proteins involved in stress reponse. The genetic approaches used in our laboratory would achieve the results complementary to those obtained by the cooperating Korean team working on protein level. The regulatory efect of small untranslated RNA (another element of stress-response network recently discovered in our laboratory) on expression of the gene coding for transcriptional regulator of GntR family will be also (en)