| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - The stress-induced small regulatory RNAs (sRNAs) typically function by base-pairing with target mRNA and thereby affect the translational efficiency of target mRNA. Hfq, a bacterial RNA chaperon, facilitates these sRNA/mRNA interactions. The aim of this project is to elucidate the roles of Hfq and sRNAs in physiological fitness and in virulence of pathogenic Bordetella pertussis.The function of Hfq in B. pertussis will be analyzed by construction of an hfq mutant and by comparison of the hfq+/hfq- expression patterns by means of microarray and proteomics. Next, we will perform genome-wide search for sRNAs in B. pertussis using bioinformatics, RNomics, and microarray analysis. We will attempt to identify genes, which expression will be modulated by identified sRNAs in our screens, especially those involved in survival under stress conditions and in virulence. This complex approach will allow us to evaluate the impact of Hfq and identified sRNAs on physiology and pathogenicity of B. pertussis. (en)
- Malé regulační RNA (sRNA) se díky své komplementaritě váží k cílové mRNA a ovlivňují účinnost její translace. Hfq, bakteriální RNA chaperon, je díky svým RNA-vazebným vlastnostem důležitým prostředníkem těchto RNA-RNA interakcí a hraje také důležitou úlohu ve virulenci patogenních bakterií. Cílem tohoto projektu je zjistit jakou roli hraje Hfq protein a sRNA ve virulenci gram-negativní patogenní baktérie Bordetella pertussis, původce černého kašle. Funkci Hfq v tomto mikroorganizmu budeme sledovat porovnáním genové exprese ve wt a hfq mutantu pomocí microarray a proteomové analýzy. Tyto experimenty nám umožní identifikovat geny, jejichž exprese je regulována Hfq. Dalším cílem bude identifikace sRNA v kmenech B. pertussis kombinací různých přístupů a metod včetně bioinformatiky, RNomiky a microarray analýzy. Získané informace budou vyhodnoceny s cílem získat ucelenou představu o identifikovaných sRNA, jim iregulovaných mRNA a také o roli, kterou pro jejich interakci hraje Hfq protein. (cs)
|
| Title
| - The role of RNA chaperone Hfq and small RNAs in physiological fitness and virulence of Bordetella pertussis (en)
- Role RNA chaperonu Hfq a regulačních sRNA ve fyziologii a virulenci Bordetella pertussis (cs)
|
| http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
| |
| http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...avai/druh-souteze
| |
| http://linked.open...domain/vavai/faze
| |
| http://linked.open...vavai/hlavni-obor
| |
| http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...i/hlavni-ucastnik
| |
| http://linked.open...vavai/id-aktivity
| |
| http://linked.open.../vavai/id-souteze
| |
| http://linked.open...n/vavai/kategorie
| |
| http://linked.open...vai/klicova-slova
| - Hfq; sRNA; post-transcriptional regulation; virulence; Bordetella (en)
|
| http://linked.open...avai/konec-reseni
| |
| http://linked.open...nujicich-prijemcu
| |
| http://linked.open...avai/poskytovatel
| |
| http://linked.open...avai/start-reseni
| |
| http://linked.open...ai/statni-podpora
| |
| http://linked.open...vavai/typProjektu
| |
| http://linked.open...ai/uznane-naklady
| |
| http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
| |
| http://linked.open...cet-spoluprijemcu
| |
| http://linked.open...ai/pocet-vysledku
| |
| http://linked.open...ku-zverejnovanych
| |
| is http://linked.open...ain/vavai/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)