About: Automatic analysis of light and electron microscopy neuronal data     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • "Navrhovaný projekt ja částí širšího úsilí k získání ""schématu mozku"" - detailního popisu části nervové tkáně, typů a pozic neuronů v tkáni a jejich propojení, geometrie axonů a dendritů, velikosti synapsí a dalších parametrů. Vyvineme algoritmy pro společnou analýzu obrazů ze světelné mikroskopie (zejména konfokální a dvoufotonové) a 3Delektronové mikroskopie (hlavně FIB/SEM - rastrovací mikroskop siontovým svazkem), které budou umět segmentovat 3D obrazy z elektronové mikroskopie za pomoci obrazů z mikroskopie světelné. Budeme identifikovat a klasifikovat neurony a další subcelulární struktury. Automaticky vytvoříme strom dendritů a axonů a určíme propojení mezi neurony. Důležitou součástí práce bude registrace obrazů z obou modalit." (cs)
  • This project is a small part of an effort to obtain what is sometimes called the 'brain wiring diagram' - a detailed description of a part of the neural tissue, the sizes, shapes, types and positions the neurons in the tissue and especially their connectivity pattern, the geometry of the axons and dendrites, the size of the synapses and perhaps other parameters of interest. We plan to develop algorithms for the joint analysis of 3D light microscopy (mainly confocal microscopy and two-photonmicroscopy) and 3D electron microscopy (mainly a focused ion beamscanning electron microscopy, FIB/SEM), which will segment the 3Delectron microscopy images with the help of the light microscopy images, identifying and classifying the neurons and various other subcellular structures. We will also automatically trace the dendrites and axons, forming a tree and determining connectivity between the neurons. An important part of the project will be the development of technique for registering electron and light microscopy images. (en)
Title
  • Automatic analysis of light and electron microscopy neuronal data (en)
  • Automatická analýza obrazů nervové tkáně ze světelné a elektronové mikroskopie (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...i/hlavni-ucastnik
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • electron microscopy; 3D; image processing; neurons; segmentation; image registration (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software