Cílem toho projektu je přispět k mezinárodnímu úsilí zaměřenému na identifikaci genů kontrolujících ukládání tuku. Je to důležité jak pro výrobu zdravějšího vepřového masa (nižším obsah tuku v jatečním těle) vyhovujícího požadavkům konzumentů (2-3% nitrosvalového tuku), tak z hlediska využití prasete jako modelového zvíře pro studium genetiky lidské obesity. Ukládání tuku je kvantitativní vlastnost, která je ovlivňována genetickými vlivy (lokusy kvantitativních znaků - QTL) a vlivy prostředí. Námi a jinými skupinami provedené celogenomové mapování QTL a asociační studie u kříženců plemene Meishan se Západními plemeny identifikovaly QTL pro ukládání tuku na chromozómu X (SW259 - SW1943), na q raménku chromozomu 2 (RESTN) a na chromozómu 13 (ADIPOQ). Provedeme parciální klonování vybraných genů z homologních lidských chromozómových úseků a jejich vazbové mapování na USDA MARC referenční rodině. Za účelem detailního QTL mapování provedeme asociační studii výše zmíněných genů u kohorty 1 000 (cs)
The objective of this project is to contribute to international endeavour focused on finding genes underlying porcine variability in fat deposition . This is important for the pig industry to produce healthier (low fat content in carcass) and consumer acceptable (2 - 3% intramuscular fat) pork and for the pig as a model animal for study of human obesity. Fat deposition is quantitative trait influenced by genetic (quantitative trait loci - QTLs) and environmental factors. The whole genome QTL mapping and association studies performed by us and other groups in Meishan x Western breed crosses revealed QTLs for fat accretion on chromosome X (SW259 - SW1943), on q arm of the chromosome 2 (RETN) and on chromosome 13 (ADIPOQ). We will perform partial cloning of selected genes from homologous human chromosome regions and their linkage mapping in USDA MARC backcross pedigree. For a more detailed QTL mapping we perform association analysis of genes located within regions, in a cohort of 1, 000 crosses (en)