About: Sequencing and the genome analysis of the strawberry vein banding virus     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • The project will bring original knowledge about the sequence and genome arrangement of the Strawberry vein banding virus (SVBV), which is a new virus recently found in the Europe. The virus will be isolated from infected strawberry plants, where the presence of SVBV will be confirmed by S-blotting. Viral nucleic acid will be isolated and fragmented by restriction endonucleases, cloned into plasmid following standard producers and sequenced. Sequence and the genome arrangement of the SVBV will be analysed and compared with other caulimoviruses. Its sequence will be screened and specific primers for routine diagnosis of the virus by PCR will be prepared. Promoter directed the synthesis of the whole virus genome transcript will be selected from the bank of clones and used in artificial construction to control the expression of ß-glucuronidase (GUS) marker gene. (en)
  • Projekt má přinést nové poznatky o sekvenci, uspořádání genomu a jeho regulačních elementů v Evropě nově popsaného viru lemování žilek jahodníku (Strawberry vein banding virus). Virus bude izolován z infikovaných rostlin jahodníku, ve kterých bude přítomnost SVBV potvrzena S-blottingem. Virová DNA bude standardními metodami fragmentována, klonována do pBS plasmidu a sekvenována. Získaná sekvence bude analyzována, porovnána se sekvencemi jiných caulimovirů a budou podle ní připraveny specifické púriméry pro rutinní diagnostiku viru metodou PCR. Z vytvořené banky klonů bude vybrán klon obsahující virový promotor řídící syntézu genomové mRNA. Tento promotor bude upraven restrikčním štěpením a začleněn do plasmidu, kde bude řídit expresi signálního genu beta-glucuronidázy (GUS). (cs)
Title
  • Sekvenování a analýza genomu viru lemování žilek jahodníku (cs)
  • Sequencing and the genome analysis of the strawberry vein banding virus (en)
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software