About: Construction of BAC library and physical mapping of the wheat chromosome 3D     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • The large size and polyploid nature of the nuclear genome of bread wheat pose a great challenge for the understanding of complete genome information, genome sequencing and gene discovery. This task could be simplified by fractionating the genome into small and defined parts. Here we propose to create two subgenomic BAC libraries specific for short and long arm of wheat chromosome 3D. Their creation will mark the completion of BAC resources for homeologous group 3, which has been selected for the pilot phase of the wheat genome sequencing project. 3D-specifc BAC resources developed in this project will be used to develop a molecular cytogenetic map and, in collaboration with Prof. J. Dvořák (UC, Davis), a physical contig map of 3D. They will alsobe used for targeted isolation of low-copy (potentially coding) DNA sequences, discovery of gene-rich regions on 3D, and for high-throughput mapping of expressed sequences to chromosome 3D using wheat GeneChip (collaboration with Prof. T. Close, UC, (en)
  • Značná velikost a polyploidní původ jaderného genomu pšenice seté komplikují jeho sekvenování, analýzu a klonování genů. Tyto postupy mohou být zjednodušeny rozdělením genomu na malé definované části. Navrhujeme připravit dvě subgenomové knihovny DNA klonované ve vektoru BAC, specifické pro krátké a dlouhé rameno chromozómu 3D. Jejich konstrukcí bude dokončena příprava genomových zdrojů pro homeologní skupinu 3, která byla mezinárodním konsorciem zvolena pro pilotní fázi sekvenování genomu pšenice. BAC knihovny specifické pro chromozóm 3D použijeme pro odvození cytogenetické mapy a ve spolupráci s J. Dvořákem (UC, Davis) pro přípravu fyzické mapy chromozómu. Použijeme je rovněž pro izolaci potenciálně kódujících sekvencí DNA, identifikaci genově bohatých oblastí a pro hromadné mapování exprimovaných sekvencí DNA na chromozómu 3D pomocí DNA čipu (ve spolupráci s T. Close, UC, Davis). Řešení projektu otevře nové možnosti pro komparativní analýzu evoluce genomu pšenice a studium interakce jejích (cs)
Title
  • Construction of BAC library and physical mapping of the wheat chromosome 3D (en)
  • Konstrukce BAC knihovny a fyzické mapování chromozómu 3D pšenice (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • Cytogenetic map; Physical map; Coding sequences (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software