Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
Description
| - The large size and polyploid nature of the nuclear genome of bread wheat pose a great challenge for the understanding of complete genome information, genome sequencing and gene discovery. This task could be simplified by fractionating the genome into small and defined parts. Here we propose to create two subgenomic BAC libraries specific for short and long arm of wheat chromosome 3D. Their creation will mark the completion of BAC resources for homeologous group 3, which has been selected for the pilot phase of the wheat genome sequencing project. 3D-specifc BAC resources developed in this project will be used to develop a molecular cytogenetic map and, in collaboration with Prof. J. Dvořák (UC, Davis), a physical contig map of 3D. They will alsobe used for targeted isolation of low-copy (potentially coding) DNA sequences, discovery of gene-rich regions on 3D, and for high-throughput mapping of expressed sequences to chromosome 3D using wheat GeneChip (collaboration with Prof. T. Close, UC, (en)
- Značná velikost a polyploidní původ jaderného genomu pšenice seté komplikují jeho sekvenování, analýzu a klonování genů. Tyto postupy mohou být zjednodušeny rozdělením genomu na malé definované části. Navrhujeme připravit dvě subgenomové knihovny DNA klonované ve vektoru BAC, specifické pro krátké a dlouhé rameno chromozómu 3D. Jejich konstrukcí bude dokončena příprava genomových zdrojů pro homeologní skupinu 3, která byla mezinárodním konsorciem zvolena pro pilotní fázi sekvenování genomu pšenice. BAC knihovny specifické pro chromozóm 3D použijeme pro odvození cytogenetické mapy a ve spolupráci s J. Dvořákem (UC, Davis) pro přípravu fyzické mapy chromozómu. Použijeme je rovněž pro izolaci potenciálně kódujících sekvencí DNA, identifikaci genově bohatých oblastí a pro hromadné mapování exprimovaných sekvencí DNA na chromozómu 3D pomocí DNA čipu (ve spolupráci s T. Close, UC, Davis). Řešení projektu otevře nové možnosti pro komparativní analýzu evoluce genomu pšenice a studium interakce jejích (cs)
|
Title
| - Construction of BAC library and physical mapping of the wheat chromosome 3D (en)
- Konstrukce BAC knihovny a fyzické mapování chromozómu 3D pšenice (cs)
|
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
| |
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
| |
http://linked.open...avai/druh-souteze
| |
http://linked.open...domain/vavai/faze
| |
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
| |
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
| |
http://linked.open...vavai/id-aktivity
| |
http://linked.open.../vavai/id-souteze
| |
http://linked.open...n/vavai/kategorie
| |
http://linked.open...vai/klicova-slova
| - Cytogenetic map; Physical map; Coding sequences (en)
|
http://linked.open...avai/konec-reseni
| |
http://linked.open...nujicich-prijemcu
| |
http://linked.open...avai/poskytovatel
| |
http://linked.open...avai/start-reseni
| |
http://linked.open...ai/statni-podpora
| |
http://linked.open...vavai/typProjektu
| |
http://linked.open...ai/uznane-naklady
| |
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
| |
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
| |
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
| |
http://linked.open...ku-zverejnovanych
| |
is http://linked.open...ain/vavai/projekt
of | |