"Microsatellite (Simple Sequence Repeats, SSR) markers for the discrimination and identitication of flax and linseed cultivars will be developed. Cultivar-specific microsatellite markers will be generated by a) microsatellite-directed PCR (MS PCR), b) by screening of microsatellite-enriched libraries. Research activity b) will be accomplished within the framework of international flax collaboration consortium coordinated from Canada. Within this collaboration our research team will guarantee sequencing oat least 100 clones from these libraries per year. Design and testing of PCR primer pairs from flanking regions of sequenced SSR-loci aim to development of routine PCR assay for flax cultivar identification. SSR markers from MS-PCR will be cloned and tested for informational value in order to construct cultivar-specific discriminators for routine fingerprinting assays. Fingerprinting data will be stored and processed in high-international standard environment ""GelCompar"" software package (investment)" (en)
"Podstatou řešení projektu je vývoj mikrosatelitních (SSR) markerů pro identifikaci a rozlišení kultivarů a genotypů lnu. Kultivar specifické mikrosatelitní markery budou generovány a) pomocí ""microsatellite-directed PCR"" (MS-PCR), b) skrinováním SSR-obohacených knihoven. Projektová aktivita b) bude realizována v rámci mezinárodního lnového konzorcia koordinovaného z Kanady. V rámci této spolupráce náš tým bude garantovat osekvenování nejméně 100 klonů ročně z mikrosatelitních knihoven. Navrhována testování primerů pro SSR lokusy bude pak směřovat k vyvinuti rutinního PCR testu pro identifikaci kultivarů lnu. SSR markery z MS-PCR budou klonovány a testován jejich polymorfismus s cílem konstrukce kultivarových diskriminátorů pro rutinní fingerprinting lnu. Data z fingerprintingových testů kultivarů budou zpracovávána v softwarovém prostředí ""GelCompar"", což je mezinárodně uznávaný standard (požadovaný jako investice). SSR sekvence, ""flanking primer"" sekvence a data fingerprintingu" (cs)