About: Structural and functional determinants on channels TRPC3, TRPV1, TRPV2 and TRPA1     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Superrodina  transient receptor potential (TRP) kanálů se skládá ze tří hlavních rodin, TRPC, TRPV a TRPM. TRPC tvoří rodinu sedmi kanálů propustných pro Ca2+. Všechny  TRP kanály  mají podobnou strukturu šesti transmembránových domén, mezi pátou a šestou transmembránovou doménou je oblast poru, která je lokalizována v membráně a umožňuje propustnost iontů a v intracelulárním prostoru umístěné jak N- či C-konce kanálu. Budou zjištěny sekundární struktury N-C- intracelulárních kosů u kanálů TRPC3, TRPV1, TRPV2 a TRPA1. Dále budou určena vazebná místa pro calmodulin na obou koncích TRPV2 a TRPA1 a na C- konci TRPV1. Měli by být zjištěny vazebná místa pro adaptorové proteiny jako je eferin nebo junctate na TRPV1, TRPV2 a TRPA1.  Bude určena struktura vazebného místa pro ATP, tzv. Walkerova motivu A na C konci v Walker motivu B na  N konci TRPV1. Dále bude zjištěna funkce selektivního filtru v póru kanálu TRPC3 a TRPV1 a popsána úloha jednotlivých aminokyselinových zbytků v C konci alfa (cs)
  • The main aims of this proposal are to determine of the secondary structures of N- and C - intracellular termini of channels TRPC3, TRPV1, TRPV2 and TRPA1. In addition to localize of binding sites for calmodulin on both termini of TRPV2 and TRPA1, and on C- termini of TRPV1, to describe the binding sites for adaptor proteins like eferin or junctate on TRPV1, TRPV2 and TRPA1, the binding sites for ATP (in case of TRPV1 Walker motif A in C -termini and Walker motif in N-termini ) and precise localization of caveolin binding site on  N - termini of TRPC3. The series of different lengths of fusion proteins of both termini of four channels will be performed to get sufficient amounts of soluble proteins. Another goal will be to localize the selectivity filter in the P loop between TM5 and TM6 in TRPC3 and TRPA1 respectively, and to describe the role of the of aminoacids residues in the lower part of alpha- helix of TM6 in gating process of  TRPV2, TRPC3 and TRPA1 channels. (en)
Title
  • Strukturní a funkční determinanty na kanálech TRPC3, TRPV1, TRPV2 a TRPA1 (cs)
  • Structural and functional determinants on channels TRPC3, TRPV1, TRPV2 and TRPA1 (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • TRP channels; structure; transmembrane domain; N- and C-termini; molecular model (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 107 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software