About: Karyotype evolution in the mustard family (Brassicaceae)

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Karyotype evolution in the mustard family (Brassicaceae) Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Evolutionary changes of chromosomes and karyotypes over time can be studied by comparative chromosome painting (CCP). CCP refers to visualization of homeologous chromosome regions/whole chromosomes shared by two or more species. Among plants this technique is only feasible for the mustard family (Brassicaceae). In the project, a robust infrastructure for CCP within Brassicaceae will be established. Painting probes for all chromosomes of Arabidopsis thaliana (thale cress) will be used to identify homeologous chromosomes in other cruciferous species. These experiments will reveal chromosomal changes responsible for the deviating chromosome numbers and define ancient versus advanced karyotypes. Comparisons of chromosomal homeology patterns with molecular phylogenetic distances will provide unique insights into the general trends and timing of karyotype evolution in Brassicaceae, and the role of chromosomal changes in plant speciation. (en) Evoluční přestavby karyotypu mohou být rekonstruovány pomocí komparativního chromosomálního paintingu (KCP). Metoda KCP je založena na vizualizaci homeologických chromosomálních úseků/celých chromosomů sdílených dvěmi nebo více druhy. U rostlin je tato technika aplikovatelná jen u zastupců čeledi brukvovitých (Brassicaceae). Navrhovaný projekt si klade za cíl vytvořit nezbytné technické a metodologické zázemí pro širší aplikaci KCP v rámci Brassicaceae. KCP s použitím DNA sond pro všechny chromosomy huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) umožní identifikovat homeologické chromosomy u dalších druhů. Navrhované experimenty dovolí specifikovat chromosomální změny zodpovědné za rozdílné chromosomové počty a definovat ancestrální a odvozené karyotypy. Porovnání chromosomálních a molekulárně-fylogenetických dat poskytne jedinečné informace o obecných trendech a časové struktuře evoluce karyotypu brukovitých, stejně jako o roli chromosomálních přestaveb při vzniku rostlinných druhů. (cs)
Title	Karyotype evolution in the mustard family (Brassicaceae) (en) Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae) (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/KJB601630606
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/36439630
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EB
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EA
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/KJ
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SAV02006-B
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	comparative chromosome painting; Arabidopsis; Brassicaceae; crucifers; karyotype and chromosome evolution; genome colinearity; BAC; multicolour FISH; plant molecular phylogenetics and systematics; plant phylogenomics (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2008-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/AV0
http://linked.open...avai/start-reseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	1739 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	1739 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	18 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	18 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2006/KJB601630606/orjk-14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2007/KJB601630606/orjk-14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2008/KJB601630606/orjk-14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2009/KJB601630606/orjk-14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 107 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software