"The project is focused on the synthesis and evaluation of a new structural type of fluorescence quenchers used in non-radiative labeling of biomolecules. Fluorescence labeling is widely used method for biomolecule detection. Some methods in DNA detection and quantitative analysis employ combination of two dyes, of which the first is a fluorescent one and the other is a ""quencher"" of fluorescence. This project is focused on the quenchers suitable for fluorophores emitting light at (but not only) higher wavelengths, where some challenge still remains due to insufficient stability of the quenchers. Proposed azaphthalocyanine (AzaPc) molecules possess several advantageous properties for such application and are chemically stable. Project solves not only synthesis but also biomolecular evaluation of the quenching efficiency of newly prepared compounds using hybridization assays. Both static and dynamic (FRET) quenching will be tested." (en)
Předkládaný projekt si klade za cíl připravit a hodnotit novou skupinu zhášečů fluorescence pro značení biomolekul, zejména oligonukleotidových sond. Fluorescenční značení biomolekul je v současnosti velice rozšíření biomolekulární metoda detekce. Jedna z metod využívá dvě barviva – jedno fluorescenční a druhé fungující jako zhášeč fluorescence. Tento projekt je zaměřen na syntézu a hodnocení zhášečů fluorescence pro fluorofory emitující (nejen) při vyšších vlnových délkách, kde v současné době stále zůstává stále problém s dostupnými zhášeči, zejména co se týče jejich chemické stability. Navržené struktury azaftalocyaninů (AzaPc), které dosud nebyly v této aplikaci nikdy použity, mají řadu velice výhodných vlastností pro tuto aplikaci a jsou chemicky stabilní. Projekt řeší syntézu vhodných AzaPc i biomolekulární testy nových zhášečů použitím hybridizací značených oligonukleotidových sond. Obě možnosti zhášení fluorescence – statické i dynamické zhášení (FRET) - budou testovány. (cs)