About: Computational study of RNA multiple junctions localized in functionally important sites of the ribosome

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Computational study of RNA multiple junctions localized in functionally important sites of the ribosome Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	The project is focused on study of ribosomal RNA multiple junctions complex molecules composed of RNA motifs/submotifs. These systems consist of non-standard pairs and have specific structure dynamical properties that assert in synthesis of proteins. The proposal is aimed at description of these systems using modern molecular dynamics methods and bioinformatics, and determination of their functional roles. Structural dynamics, basepairing, specific hydration and ion binding and also molecular interactions of selected systems will be characterized on nanoseconds time scales. Computations will be complemented by sequence analysis. Based on obtained results and current experimental data functional roles of selected junctions in proteosynthesis will be suggested. Characterization of ribosomal RNA motifs/submotifs represents a significant task because these structures do not occur only in the ribosome but also in other RNA molecules where they assert in key processes. (en) Projekt se zaměřuje na studium ribozomálních RNA multiple junction, což jsou komplexní molekuly složené z RNA motivů/submotivů. Tyto systémy jsou tvořeny ne-standardními páry bází a mají specifické strukturně dynamické vlastnosti, které se uplatňují při syntéze proteinů. Navrhovaný projekt si klade za cíl popsat tyto systémy pomocí molekulově dynamických metod a bioinformatiky a určit jejich funkční role. U vybraných systémů bude na nanosekundových časových škálách charakterizována strukturní dynamika, párování bází, specifická hydratace a vazba iontů, a také molekulové interakce. Studie budou doplněny sekvenčními analýzami. Na základě získaných výsledků a současných experimentálních dat budou navrženy funkční role vybraných RNA junction v procesu syntézy proteinů. Charakterizace ribozomálních RNA motivů/submotivů představuje důležitou úlohu neboť tyto struktury se kromě ribozomu vyskytují také v dalších molekulách RNA kde se uplatňují při klíčových procesů. (cs)
Title	Počítačová studie RNA multiple junction lokalizovaných ve funkčně významných místech ribozomu (cs) Computational study of RNA multiple junctions localized in functionally important sites of the ribosome (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/KJB400040901
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EB
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/54154861
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/CE
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/BO
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/KJ
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SAV02009-B
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	computational modeling; ribonucleic acids; ribosome; base pairs; molecular dynamics; bioinformatics (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2011-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/AV0
http://linked.open...avai/start-reseni	2009-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	717 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	717 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	10 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	10 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2009/KJB400040901/ico-68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2010/KJB400040901/ico-68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2011/KJB400040901/ico-68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2012/KJB400040901/ico-68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software