About: Effects of drugs on radiation induced damages of DNA     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Projekt je zaměřen na teoretické modelování účinku ionizujícího záření (IZ) na komplexy DNA s různými ligandy (interkalátory, ligandy v malé a velké rýze). Navrhovaný přístup využívá dříve vytvořený teoretický model, který simuluje účinek volných radikálů vzniklých radiolýzou prostředí obklopujícího studovanou DNA. Model je založen na simulační metodě Monte Carlo (simulace vzniku a difuse radikálů) a teorii Smoluchowského (chemické reakce radikálů s DNA a ligandy). Třídimensionální atomické struktury komplexů DNA-ligand používané v simulacích budou získány buďto z databank (PDB, NDB) a nebo budou určeny molekulárním modelováním pomocí minimalizace energie studovaných komplexů (program SYBYL). Pravděpodobnosti reakcí radikálů s reačními místy DNA a ligandů budou porovnávány s parametry struktury komplexů a dostupnými experimentálními daty. Výsledky budou analyzovány s ohledem na výtěžky a závažnost poškození DNA způsobených IZ. (cs)
  • The project includes simulation of radiation attack on DNA complexes with ligands interacting by intercalation, minor or major groove binding. The suggested approach applies an original theoretical model which takes into account the effects of free radicals produced by the radioation in DNA surrounding. Our recently developed model is based on Monte Carlo simulation method (simulation of origin and diffusion of radicals) and Smoluchowski theory (chemical reactions of radicals with ligands and DNA).The three-dimensional atomic structures of DNA-ligand complexed used in simulations will be obtained from structure databanks (PDB, NDB) or will be calculated by the energy minimization of studied complexes (software SYBYL). Probabilities of radical attack to the reaction sites of DNA and ligands will be calculated and compared to the structural parameters of complexes. The results will be analyzed in relation to radiation induced DNA damages. (en)
Title
  • Vliv ligandů na radiačně indukovaná poškození DNA (cs)
  • Effects of drugs on radiation induced damages of DNA (en)
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software