About: Phylogeny of bodonid and coccidian protozoa based on small subunit rRNA and conserved protein sequences     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Our aim is to study phylogenetic relationship of selected bodonid and coccidian protozoa based on the small subunit (SSU) rRNA and conserved protein sequences. Primitive flagellates of the suborder Bodonia (order Kinetoplastida) represent important model for studies of the evolution of RNA editing, kinetoplast DNA structure, and the acquisition(s) of parasitism. The phylogenetic analysis of available free-living and parasitic species will be performed by means of the SSU rRNA and topoisomerase II gene sequences. In the second part of this project phylogenetic analysis of the SSU rRNA sequences of members of the subclass Coccidia (phylum Apicomplexa) parasitizing lower vertebrates will be performed. We will ude already available set of representative species that differ in the type of life cycle, morphology, and location in the host. Since so far, apicomplexan phylogeny is based only on morphology and the SSU rRNA data, we will search for another useful conserved gene. (en)
  • Cílem projektu je studium fylogenetických vztahů vybraných zástupců skupin Bodonia a Coccidia. Primitivní bičíkovci podřádu Bodonia představují významnou modelovou skupinu z hlediska evoluce kinetoplastidové DNA, editování RNA či vzniku parazitismu. Pomocí sekvencí malé podjednotky ribosomální RNA a topoisomerázového genu chceme provést první fylogenetickou analýzu parazitických a volně žijících zástupců tohoto podřádu. V projektu je dále navržena první analýza fylogenetických vztahů parazitických prvoků podtřídy Coccidia parazitujících u nižších obratlovců. Vybraní zástupci se liší charakterem svých vývojových cyklů, morfologií i orgánovou lokalizací a jsou proto vhodným objektem pro fylogenetickou analýzu této skupiny. Získaná data umožní posoudit evoluční vztahy v rámci anylyzované skupiny a případnou koevoluci s finálními hostiteli či mezihostiteli. (cs)
Title
  • Fylogenetická analýza vybraných prvoků (Bodonina a Coccidia) prostřednictvím SSU rRNA a konzervativních proteinů (cs)
  • Phylogeny of bodonid and coccidian protozoa based on small subunit rRNA and conserved protein sequences (en)
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • molecular phylogeny; Kinetoplastida; Bodonida; Coccidea; Sarcocystis; Hammondia; Trypanosoma; Goussia; Isospora; Eimeria; (en)
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 11 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software