About: Diversity and activity of soil microbial communities: expression of selected genes of secondary metabolism in relationship to envoronmental factors     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Complex composition of soil habitats implies high diversification of relationships among soil organisms. Actinomycetes bring to the soil environment extensive secondary metabolism, which appears to be a less known factor determining bacterial diversity within a wide range of nabitats. Bacterial community will be studied using microarrays: species diversity and activity using oligonucleotide probes of 16S rDNA sequences, and distribution of secondary metabolic and resitance genes using oligonucleotide gene specific probes, both targeted by eDNA and eRNA. Also, community response to bioactive compound production and other environmental factors will be sought. A long-term observation and manipulation experiment are proposed. A field study on actinomycetes, enriched by information from applied research on antibiotic production in our laboratory, could bring a new understanding of secondary metabolism evolution, horizontal gene transfer in nature and biodiversity at a molecular level. (en)
  • Různorodost půdního prostředí předpokládá vysokou diversifikaci vztahů mezi půdními organismy. Aktinomycety ovlivňují půdní prostředí produkty sekundárního metabolismu, jenž je málo prozkoumaným faktorem působícím na diversitu v různých podmínkách. Bakteriální společenstvo bude studováno pomocí mikročipů: diversita a aktivita druhů oligonukleotidovými sondami z 16S rDNA sekvencí a výskyt genů sekundárního metabolismu a resistence genově specifickými sondami. Oba typy čipů budou hybridizovány eDNA i eRNA. Reakce společenstva na produkci bioaktivních látek a další faktory prostředí bude sledována během manipulačního pokusu a dlouhodobě na terenních lokalitách. Tato studie, v kombinaci s výsledky aplikovaného výzkumu antibiotik v naší laboratoři, by měla přinést nové poznatky o evoluci sekundárního metabolismu, horizontálním přenosu genů v přírodě a biodiversitě na molekulární úrovni. (cs)
Title
  • Diversita a aktivita mikrobiálních společenstev v půdě: exprese vybraných genů primárního i sekundárního metabolismu ve vztahu k faktorům prostředí (cs)
  • Diversity and activity of soil microbial communities: expression of selected genes of secondary metabolism in relationship to envoronmental factors (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • biodiversity; secondary metabolism; resistance; activity; soil (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software