| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Projekt studuje vnitrogenomovou variabilitu 16S rDNA u symbiotických bakterií a její vliv na rekonstrukci fylogenetických a koevolučních vztahů. V předchozích studiích jsme zjistili, že odlišné kopie 16S rDNA z genomu symbionta triatom, Arsenophonus triatominarum, poskytují navzájem neslučitelné fylogeneze. Společně se značným posunem v nukleotidovém složení genů ukazuje toto zjištění, že vztah mezi A. triatominarum a hostitelem je zřejmě staršího data, než by vyplývalo z inkongruence jejich fylogenezí. Předpokládáme, že tento jev se vztahuje i na další symbiotické bakterie a měl by být zohledněn v koevolučních studiích. V rámci projektu bude mapováno množství a celková variabilita kopií 16S rDNA v různých liniích rodu Arsenophonus. Pro doplnění souboru dat, bude provedeno vyhledávání dalších linií v různých skupinách hmyzu. Jako doplňujícího kritéria pro posouzení relativního stáří symbiotických vztahů bude použita míra posunu v nukleotidovém složení a výpočet divergenčních časů. (cs)
- The project investigates 16S rDNA intragenomic heterogeneity in symbiotic bacteria and its influence on reconstruction of coevolutionary relationships. Our previous research showed that in Arsenophonus triatominarum, symbiont of triatomines, different copies of 16S rDNA provide conflicting phylogenies. This finding, together with high degree of compositional bias, suggests that A. triatominarum may have been associated with its host for considerably longer time than indicated by their incongruent phylogenies. We suggest that this phenomenon applies to other secondary symbionts and should be taken into account when inferring the coevolution. In the project, we map number and heterogeneity of 16S rDNA copies in lineages of Arsenophonus bacteria. To obtain more complex picture, we will screen for additional Arsenophonus lineages in insects. We use the degree of composition bias and the calculation of divergence times as subsidiary source of information on relative age of the associations. (en)
|
| Title
| - Vliv vnitrogenomové variability rDNA na koevoluční analýzu ve vztahu hmyz-symbiont (cs)
- An effect of rDNA intragenomic variability on coevolutionary analysis in insect-symbiont associations (en)
|
| http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
| |
| http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...avai/druh-souteze
| |
| http://linked.open...domain/vavai/faze
| |
| http://linked.open...vavai/hlavni-obor
| |
| http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...vavai/id-aktivity
| |
| http://linked.open.../vavai/id-souteze
| |
| http://linked.open...n/vavai/kategorie
| |
| http://linked.open...vai/klicova-slova
| - coevolution, symbiosis, molecular phylogenetics (en)
|
| http://linked.open...avai/konec-reseni
| |
| http://linked.open...nujicich-prijemcu
| |
| http://linked.open...avai/poskytovatel
| |
| http://linked.open...avai/start-reseni
| |
| http://linked.open...ai/statni-podpora
| |
| http://linked.open...vavai/typProjektu
| |
| http://linked.open...ai/uznane-naklady
| |
| http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
| |
| http://linked.open...cet-spoluprijemcu
| |
| http://linked.open...ai/pocet-vysledku
| |
| http://linked.open...ku-zverejnovanych
| |
| is http://linked.open...ain/vavai/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)