About: Evolution of metabolic pathways in complex plastid of the diatom Thalassiosira pseudonana

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Evolution of metabolic pathways in complex plastid of the diatom Thalassiosira pseudonana Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	"Diatoms possess mutlimembraned complex plastid. Such plastids have evolved during the process of secondary endosymbiosis, when unicellular photosynthetic eukaryote (in the case of diatoms rhodophyte) was engulfed by other unicellular eukaryote. During the evolution, the engulfed endosymbiont was reduced to the form of plastid surrounded by more than two membranes. Most proteins used in such plastid are nuclear-encoded and posttranslationally imported into the complex platid using bipartite targeting presequence. Preliminary analyses of the diatom genome show that plastid metabolic pathways are composed also of enzymes displaying other than expected cyanobacterial (plastid) origin. The project is directed to search for the diatom genes encoding putatively platid-targeted proteins, in silico analysis of their targeting sequences and phylogenetic analyses. In some cases, the 5""-RACE approach will be used to specify 5"" - end of transcripts." (en) "Rozsivky obsahujíá vícemembránový komplexní plastid. Ten vznikl během procesu označovaného jako sekundární endosymbióza, kdy byl jednobuněčný fotosyntetický eukaryot (v případě rozsivek červená řasa) pohlcen jiným jednobuněčným eukaryotem. V průběhu evoluce byl tento endosymbiont zredukován do podoby plastidu obaleného více než dvěmi membránami. Většina proteinů používaných v plastidu je jaderně kódována a posttranslačně importována do komplexního plastidu prostřednictvím dvojdílné importní sekvence. Předběžné analýzy genomu rozsivky ukazjjí, že metabolické druhy lokalizované v plastidu obsahují též enzymy jiného, než plastidového původu, Projekt je zaměřen na vyhledávání jaderných genů kódujících proteiny potenciálně targetované do plastidu rozsivek, in silico analýzu jejich targetovacích sekvencí a fylogenentickou analýzu. U některých vybraných negů, u kterých není z genomové sekvence možno specifikovat charakter targetovací sekvence, bude 5"" - konec transkriptu určen pomocí 5"" - RACE." (cs)
Title	Evolution of metabolic pathways in complex plastid of the diatom Thalassiosira pseudonana (en) Evoluce metabolických drah v komplexním plastidu rozsivky Thalassiosira pseudonana (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/IAA500220502
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EF
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/35776825
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EB
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EE
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/IA
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SAV02005-A
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	secondary endosymbiosis; complex plastid; metabolism; evolution; gene transfer; protein targeting; mosaic pathway; Thalassiosira pseudonana (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2007-12-01 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/AV0
http://linked.open...avai/start-reseni	2005-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	1264 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	1264 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	3 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	3 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2005/IAA500220502/ico-60077409 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2006/IAA500220502/ico-60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2007/IAA500220502/ico-60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2008/IAA500220502/ico-60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software