About: Role of cytosine in the conformational polymorphism of DNA     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Pomocí CD spektroskopie, PAGE a dalších metod budou řešeny následující problémy:I)Charakterizace termostabilního konformeru, který tvoří oligo(dC) při neutrálním pH, jeho úloha při tvorbě interkalovaného cytosinového kvadruplexu. II) Anomální konformace oligonukleotidů d(CnGn).III) Tvorba duplexu, quaninového a cytosinového kvadruplexu u d(CnGn) a d(GnCn), jejich kompetice a intramolekulární koexistence. IV) Konformační rovnováhy bimolekulárního duplexu a monomolekulárního vlásenkového uspořádání u oligonukleotidů bohatých na (G+C). V)Neobvyklé konformace motivů d(IC)n, d(TC)n a d(AC)n. VI) Ovlivnění konformačních vlastností oligonukleotidů alkylovými, alkenylovými a alkynylovými substituenty v poloze 5 cytosinu. VII) Srovnání konformací fragmentů DNA bohatých na (G+C) v krystalech roztoku. Výsledky pomohou pochopit úlohu shlukování cytosinů, jejich protonizace, metylace a pravidelného střídání s jinými bázemi v konformační polymorfii oblastí genomů bohatých na cytosin. (cs)
  • By CD spectroscopy and PAGE we propose to study the problems with synthetic cytosine-rich NA fragments: Characterization of a thermostable conformer that oligo(dC) forms at neutral pH, and its role in the formation of cytosine i-quadruplex. The anomalous conformation of d(CnGn) oligonucleotides.Duplex,G-quadruplex and i-quadruplex formation in the d(CnGn) and d(GnCn) fragments of DNA, their competition and intramolecular coexistence. Bimolecular duplex-foldback equilibria in the (G+C) - rich oligonucleotides. Unusual conformations of the regulerly alternating d(IC)n, d(TC)n and d(AC)n motifs. Role of alkyl, alkenyl and alkynyl substituents in position 5 of cytosine in the conformational properties of the oligonucleotides. Comparison of crystal and solution conformations of G+C)-rich DNA fragments.These studies will help to understand the role of cytosine clustering, protonation, methylation and regular alternation in the conformational polymorphism of cytosine-rich genomic regions. (en)
Title
  • Role of cytosine in the conformational polymorphism of DNA (en)
  • Úloha cytosinu v konformační polymorfii DNA (cs)
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software