About: Radiation induced damage of DNA - protein complexes     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Projekt je zaměřen na teoretické simulace účinků ionizujícího záření (IZ) na komplexy DNA s proteiny. Dříve vyvinutý model pro simulace účinku OH radikálů vzniklých radiolýzou prostředí obklopujícího studovanou biomolekulu je založen na metodě Monte Carlo (simulace vzniku a difúze radikálů) a teorii Smoluchowského (chemické reakce OH radikálů s proteiny, zahrnutí vlivu ostatních produktů radiolýzy také simulace přímého účinku IZ (excitace a ionizace atomů DNA a proteinů). Výběr studovaných komplexů DNA-protein je ovlivněn dosažitelností jejich atomárních struktur v databankách (PDB, NDB) nebo molekulárním modelováním (program SYBYL) a případně též experimentálně měřených výtěžků radiačně indukovaných poškození. Pravděpodobnosti reakcí radikálů s DNA a proteiny budou analyzovány s ohledem na strukturu komplexů a charakteristiky IZ s cílem určit výtěžky a závažnost biologických poškození. (cs)
  • The project includes theoretical simulation of radiation attack to DNA-protein complexes. Our model allows predicting the effectsof OH radicals produced by radiation in molecules` surroundings. The model is based on Monte Carlo simulation method (origin and radical diffusion) and Smoluchowski theory (radical reactions with DNA). We propose its extension for modelling radical reactions with proteins, the introduction of other radiolytic species and of the direct effect of radiation (ionizations and excitations of DNA and protein). The choice of DNA-protein complexes depends on:i) the availability of their molecular structures in databanks (PDB, NDB), ii) building by molecular modelling (software SYBYL) and iii) the availability of experimental yields of radiation-induced damages. Probabilities of radical reactions with DNA and proteins will be analyzed in terms of molecular structure and radiation parameters with the aim to obtain yields of some types of primary biological damages. (en)
Title
  • Radiačně indukovaná poškození komplexů DNA s proteiny (cs)
  • Radiation induced damage of DNA - protein complexes (en)
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • Radiation domage; radiolytic attack; DNA-protein complex; molecular structure; theoretical modeling; (en)
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software