About: Structure, function and regulation of FerB, a broad-specificity bacterial oxidoreductase of a potential ecotechnological relevance     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • The FerB enzyme of Paracoccus denitrificans was originally discovered by our group as an NAD(P)H-dependent oxidoreductase able to reduce ferric complexes, quinones and chromate. Given the potential of using FerB for bioremediation of chromium(VI) and possibly also other heavy metals, we now propose to undertake a systematic investigation of this enzyme by conventional biochemistry, structural and molecular biology. The gene encoding FerB will be amplified and cloned based on 27 known N-terminal aminoacid residues of the protein and the already published P. denitrificans whole genome sequence. Heterologous expression of the ferB gene is expected to yield large quantities of pure recombinant protein for studies on substrate specificity, stoichiometry of electron transfer and redox kinetics of the bound flavin coenzyme. Trials will also set out to crystallise FerB and collect diffraction data for structural analysis. Suicide vectors and triparental mating will serve for construction of mutant strains (en)
  • Enzym FerB z Paracoccus denitrificans byl  původně objeven naší skupinou jako NAD(P)H závislá oxidoreduktasa schopná redukovat železité komplexy, chinony a chroman. Vzhledem k možnému využití FerB pro bioremediaci šestimocného chromu a snad i jiných těžkých kovů navrhujeme nyní systematický výzkum tohoto enzymu metodami obecné biochemie a strukturní a molekulární biologie. Gen kódující FerB bude amplifikován a klonován na základě známých 27 aminokyselinových zbytků na N-konci proteinu a již zveřejněné sekvence celého genomu P. denitrificans. Očekáváme, že heterologní exprese genu ferB poskytne velká množství čistého rekombinantního proteinu pro studie zaměřené na substrátovou specifitu, stechiometrii přenosu elektronů a redoxní kinetiku vázaného flavinového koenzymu. Budou také zahájeny pokusy o krystalizaci FerB a sběr difrakčních dat pro strukturní analýzu. Sebevražedné vektory a triparentální křížení poslouží k sestrojení mutantních kmenů bez FerB a reportérových kmenů nesoucích  (cs)
Title
  • Structure, function and regulation of FerB, a broad-specificity bacterial oxidoreductase of a potential ecotechnological relevance (en)
  • Struktura, funkce a regulace FerB, širokospecifické bakteriální oxidoreduktasy s možným významem pro ekotechnologii (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • NAD(P)H:acceptor oxidoreductase; flavin; chromate; bioremediation; Paracoccus denitrificans (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 107 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software