V graviditě je doxycyklin kontraindikován, u experimentálních zvířat byly zjištěny známky embryotoxicity a fetotoxicity, doxycyklin proniká i u člověka placentární bariérou.
Rovněž při kojení nelze podávat doxycyklin. Přechází do mateřského mléka. Proniká do skeletu a zubů kojence.
(cs)