K hlavním inkompatibilitám benzalkonium chloridu patří inkompatibilita s dalšími surfaktanty, citráty, jodidy, nitráty, permanganáty, salicyláty, tartaráty a alkáliemi. Dále byly zaznamenány inkompatibility s dalšími látkami, k nimž patří aluminium, peroxid vodíku, kaolin a některé sulfonamidy.
Hexylresorcinol je též inkompatibilní s alkáliemi a oxidačními činidly.
(cs)