About: Cytogenetic mapping of plant sex chromosomes

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Cytogenetic mapping of plant sex chromosomes Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA521/06/0056
Description	The genus Silene is exceptionally useful to study early steps of sex chromosome evolution. There is a great variety of sexual reproductive systems (from bisexuality to dioecy), while the basic chromosome number is the same (2n=24). Recent data on S. latifolia show that both the X and Y chromosomes harbour active genes, but that they are slightly divergent due to the genetic degeneration of alleles in the non-recombining region of the Y. In this project we will isolate and characterise marker DNA sequences from S. latifolia sex chromosomes. X- and Y-specific libraries will be constructed using sequences obtained by microdissection and DOP-PCR amplification. These libraries will be screened with cDNA and genomic probes (female/male) in order to select clones unique for the X or Y chromosomes and clones harbouring active genes. Such clones, along with a number of X- or Y-linked genes, which are already available, will be used to isolate longer stretches of DNA for fluorescent in situ (en) Dvoudomé rostliny jsou ideálními modelovými organizmy ke studiu evoluce pohlavních chromozomů. Obzvláště vhodný je rod Silene, kde nacházíme i odlišné reprodukční systémy (od dvoudomosti až ke kosexualitě), zatímco základní počet chromozomů je shodný. Nejnovější poznatky u S. latifolia ukazují, že chromozomy X i Y nesou geny s částečnou degenerací alel z nerekombinující části Y. V rámci studia evoluce pohlavních chromozomů se zaměříme na izolaci a charakterizaci markerových sekvencí DNA původem z pohlavních chromozomů S. latifolia. Vytvoříme plazmidové knihovny z laserově mikrodisektovaných chromozomů X a Y, jež budou před klonováním amplifikovány pomocí DOP-PCR. Po hybridizaci s cDNA a genomovými sondami budou selektovány klony unikátní pro chromozom X nebo Y a dále klony, které obsahují genové oblasti. Tyto klony (společně s již dostupnými X,Y-geny) budou použity jako sondy k izolaci delších úseků DNA ve stávající fágové a BACové knihovně k mapování chromozomů S. latifolia a příbuzných
Title	Cytogenetic mapping of plant sex chromosomes (en) Cytogenetické mapování pohlavních chromozomů rostlin
skos:notation	GA521/06/0056
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F06%2F0056/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F06%2F0056/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-10-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	68675312
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	chromosome; sex; reproduction; Silene (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2008-04-25 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/521%2F06%2F0056
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2008
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2009
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02006GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2008-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EF - Botanika GE - Šlechtění rostlin
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Sex chromosomes of Silene latifolia are evolutionary young (originated about 20 MYA) and can serve to study early steps in evolution of sex chromosomes of humans. In this research project we have prepared an original technology to construct chromosome-sp (en) Pohlavní chromozomy Silene latifolia jsou vzhledem ke svému evolučnímu mládí (začaly se vyvíjet asi před 20 miliony let) považovány za ideální model ke studiu ranných fází evoluce pohlavních chromozomů člověka. V rámci plnění tohoto projektu jsme vypraco (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	chromosome reproduction sex
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F06%2F0056/2007/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F06%2F0056/2008/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F06%2F0056/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F06%2F0056/2006/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software