About: Understanding of binding of RNA polymerace I transcription factor xUBF to DNA     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • "Xenopus upstream binding factor (UBF) is an RNA polymerase I-specific transcription factor of ribosomal genes, containing five DNA binding domains (HMG box) which are exxential to promote transcription of tibosomal genes. The xUBF can bind and actively form DNA crossorvers, and to induce DNA bending and looping. The biological relevance of DNA looping and formation of DNA crossovers could be in bringing far-upstream enhancers and their cognate promoters together, and/or in establishing a stable pre-initiation complex in the promoter region of fDNA genes. The aim of the proposed project is to elucidate a mechanism by which the individual HMG boxes of the xUBF could assemble DNA crossvers, and to loop and supercoil DNA. In addition, chimeric hybrids (a ""domain-swap"") of the major DNA-binding motif of xUBF, HMG box 1, and that of the domain B of the closely related chromosomal protein HMG1 will be employed with the aim to get a detailed insight into the interaction of the HMG box with DNA." (en)
  • "Transkripční faktor RNA polymerázy I, xUBF, obsahuje 5 vzájemně propojených DNA vazebných domén (HMG box), které jsou nezbytné pro podporu transkripce ribozomálních genů. xUBF rozpoznává (a rovněž vytváří) křížové struktury DNA (""DNA crossover"") a je rovněž schopen indukovat ohyb a smyčkování DNA. Biologický význam smyčkování (ohybu) DNA a tvorby křížových struktur DNA spočívá jednak v usnadnění komunikace vzdálených regulačních elementů genů (enhancerů a promotorů), jednak pro vznik stabilního preiniciačního komplexu v promotorové oblasti rDNA genů. Cílem navrhovaného projektu je objasnit mechanismus smyčkování a superspiralizace DNA a též vzniku křížových struktur DNA vlivem HMG box domén xUBF. Za účelem detailního objasnění interakce HMG boxdomény s DNA budou konstruovány technikou záměny domén (""domain swap"") chimérní molekuly HMG boxů xUBF a evolučně podobného chromozomálního proteinu HMG1." (cs)
Title
  • Objasnění vazby transkripčního faktoru RNA polymerázy I xUBF s DNA (cs)
  • Understanding of binding of RNA polymerace I transcription factor xUBF to DNA (en)
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • HMG Box; UBF; DNA interaction; Transcription; (en)
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software