Podávání vysokých dávek fludarabin-fosfátu bylo spojeno s ireverzibilní toxicitou pro centrální nervový systém, charakteristickou pozdním oslepnutím, kómatem a smrtí. Léčba vysokými dávkami je také spojena s těžkou trombocytopenií a neutropenií způsobenou útlumem kostní dřeně. Specifické antidotum při předávkování fludarabin-fosfátem není známo. Léčba spočívá ve vysazení léku a v podpůrné terapii.
(cs)