About: Cross-Strand Coupling of a b-Hairpin Peptide Stabilized with an Aib-Gly Turn Studied Using Isotope-Edited IR Spectroscopy     Goto   Sponge   Distinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Infračervená spektroskopie byla použita ke studiu série mono- a di-izotopicky 13C=O značených b-vlásenkových peptidů stabilizovaných Aib-Gly ohybem. IČ spektra di-izotopicky značených peptidů vykazují v oblasti amide I' rozdílnou míru vibračního spřažení mezi 13C-značenými amidy, což je způsobeno odlišnostmi v lokální geometrii peptidové struktury. Mono-značené peptidy představují markery k určení frekvencí charakteristických příspěvků diagonálního silového pole (FF) nespřažených 13C=O modů. Vliv separace diagonálního FF a spřažných efektů na spektra byl použit k vysvětlení spekter mezivláknově vázaných peptidů. DFT výpočty založené na idealizovaném modelu b-vlásenkové struktury korektně predikují spektrální pásy. Rozšíření těchto modelových výsledků s ohledem na fixované konce peptidických struktur a konformační flexibilitu vede k alternativnímu způsobu interpretace jemných detailů ve spektrech. Teplotně závislé IČ studie izotopicky značených peptidů odhalily rozdíly v teplotní stabil (cs)
  • Isotope-edited IR spectroscopy was used to study a series of singly and doubly 13C=O-labeled b-hairpin peptides stabilized by an Aib-Gly turn sequence. The double-labeled peptides have amide I' IR spectra that show different degrees of vibrational coupling between the 13C-labeled amides due to variations in local geometry of the peptide structure. The single-labeled peptides provide controls to determine frequencies characteristic of the diagonal force field (FF) contributions at each position for the uncoupled 13C=O modes. Separation of diagonal FF and coupling effects on the spectra are used to explain the cross-strand labeled spectral patterns. DFT calculations based on an idealized model b-hairpin peptide correctly predict the vibrational coupling patterns. Extending these model results by consideration of frayed ends and the hairpin conformational flexibility yields an alternate interpretation of details of the spectra. Temperature-dependent isotopically labeled IR spectra reveal differenc
  • Isotope-edited IR spectroscopy was used to study a series of singly and doubly 13C=O-labeled b-hairpin peptides stabilized by an Aib-Gly turn sequence. The double-labeled peptides have amide I' IR spectra that show different degrees of vibrational coupling between the 13C-labeled amides due to variations in local geometry of the peptide structure. The single-labeled peptides provide controls to determine frequencies characteristic of the diagonal force field (FF) contributions at each position for the uncoupled 13C=O modes. Separation of diagonal FF and coupling effects on the spectra are used to explain the cross-strand labeled spectral patterns. DFT calculations based on an idealized model b-hairpin peptide correctly predict the vibrational coupling patterns. Extending these model results by consideration of frayed ends and the hairpin conformational flexibility yields an alternate interpretation of details of the spectra. Temperature-dependent isotopically labeled IR spectra reveal differenc (en)
Title
  • Cross-Strand Coupling of a b-Hairpin Peptide Stabilized with an Aib-Gly Turn Studied Using Isotope-Edited IR Spectroscopy
  • Mezivláknové interakce b-vlásenkových peptidů stabilizované přítomností Aib-Gly ohybu studované infračervenou spektroskopií izotopicky značených látek (cs)
  • Cross-Strand Coupling of a b-Hairpin Peptide Stabilized with an Aib-Gly Turn Studied Using Isotope-Edited IR Spectroscopy (en)
skos:prefLabel
  • Cross-Strand Coupling of a b-Hairpin Peptide Stabilized with an Aib-Gly Turn Studied Using Isotope-Edited IR Spectroscopy
  • Mezivláknové interakce b-vlásenkových peptidů stabilizované přítomností Aib-Gly ohybu studované infračervenou spektroskopií izotopicky značených látek (cs)
  • Cross-Strand Coupling of a b-Hairpin Peptide Stabilized with an Aib-Gly Turn Studied Using Isotope-Edited IR Spectroscopy (en)
skos:notation
  • RIV/60461373:22340/07:00019315!RIV08-MSM-22340___
http://linked.open.../vavai/riv/strany
  • 13592-13603
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • S
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 44
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 415336
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/60461373:22340/07:00019315
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • 13C isotopic labeling; b-hairpin peptides; vibrational coupling; IR thermal unfolding (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • US - Spojené státy americké
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [905884C90AE0]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Journal American Chem.Society
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 129
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Setnička, Vladimír
  • Keiderling, Timothy A.
  • Kubelka, Jan
  • Etienne, Marcus A.
  • Hammer, Robert P.
  • Huang, Rong
  • Kim, Joohyun
issn
  • 0002-7863
number of pages
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 22340
is http://linked.open...avai/riv/vysledek of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 117 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software