About: Cherry virome deep sequencing analysis and development of virus specific PCR detection tools.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Cherry virome deep sequencing analysis and development of virus specific PCR detection tools. Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=LD14004 http://www.umbr.cas.cz
Description	Using parallel sequencing (next generation sequencing), RNA virome of sweet and sour cherry will be analysed. At the same time, phytoplasmas infections resembling symptoms of virus infection will be detected by PCR. Newly found viruses will be molecularly characterized and classified, and con-served or variable parts of genomes will be reported. Genetic variability of identified phytoplasmas will be analysed. For all pathogens discovered, specific primers will be developed allowing detection of these from total RNA. The cases of virus and phytoplasma mixed infections will be recorded. (en) Pomocí paralelního sekvenování (next generation sequencing) bude analyzován RNA virom třešní a višní. Zároveň bude pomocí PCR zjištěn výskyt fytoplazem, které mohou vyvolávat příznaky podobné virovým infekcím. Nově nalezené viry či jejich kmeny budou molekulárně popsány a zařazeny, na jejich genomu budou vyhledávány konzervované a variabilní úseky. U identifikovaných fytoplazem bude charakterizována genetická variabilita. Na základě výsledků budou pro účely rutinní detekce vyvinuty specifické primery detekující všechny zjištěné patogeny z celkové RNA. Budou popsány případné směsné infekce virů a fytoplazem.
Title	Cherry virome deep sequencing analysis and development of virus specific PCR detection tools. (en) Analýza viromu třešní a višní sekvenováním nové generace a vývoj nástrojů pro specifickou detekci virů PCR.
skos:notation	LD14004
http://linked.open...avai/cep/aktivita	COST CZ
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LD14004/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/LD14004/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-29 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	101028326
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	next generation sequencing; virus; phytoplasma; cherry; sour cherry (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-05-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/MSMT-8634%2F2014-1
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMSM2014LD4
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-04-30 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-04-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	next generation sequencing virus cherry phytoplasma
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LD14004/2014/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LD14004/2015/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/LD14004/2016/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software