About: Study of inhibition of multimerization of retroviral capsid protein from HIV-1

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Study of inhibition of multimerization of retroviral capsid protein from HIV-1 Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAB4055202
Description	The aim is to develop an assay for testing inhibitors of dimerization of capsid proteins (CA). CA, as a part of Gag polyproteins plays a crucial role in assembly of innature capsids mediating the Gag-Gag interactions. CA dimerisation is essential also for formation of core during virus maturation. Both processes are necessary for production of infectious virions. Therefore, inhibitors of CA dimerisation would represent a novel calss of antiretroviral therapeutics which is desirable for complementation of drugs of choice for triple therapy currently used in the teatment of HIV-1 infection. We propose to clone gene encoding HIV-1 CA as a fusion protein to i) six-histidine anchor and ii) reporter protein (RP) (GFP, luciferase, etc). All constructs will be expressed and purified. An assay for quantitative measuring of inhibition of CA dimerization will be developed. This method is based on evaluation of capability of selected peptides to prefent binding of RP-CA to immobilized His-CA. (en) Cílem tohoto projektu je vyvinout metodiku pro testování inhibitorů dimerizace kapsidového proteinu (CA) HIV-1. CA jako součást Gag polyproteinového prekursoru hraje klíčovou roli ve skládání virové částice, které je zprostředkováno interakcemi mezi Gag-Gag polyproteiny. Dimerizace CA je také nutná pro tvorbu virového %22core%22 při zrání viru. Oba tyto procesy jsou naprosto nezbytné pro produkci infekčních virů. Z těchto důvodů by inhibitory dimerizace CA proteinu mohly representovat novou třídu antiretrovirových therapeutik, které by mohly komplementovat v současné době používatou %22triple%22 therapii při léčbě HIV-1 infekce. Navrhujeme zde klonovat geny kódující CA HIV-1 ve fúzi k i) histidinové kotvě a ii) reportérovým proteinům (GFP, luciferasa). Tyto konstrukty budou exprimovány a příslušné proteiny purifikovány. Bude vyvinuta metodika pro kvantitativní stanovení inhibice dimerizace CA na základě schopnosti vybraných peptidů zabránit vazbě reportérový protein-CA k His-CA.
Title	Study of inhibition of multimerization of retroviral capsid protein from HIV-1 (en) Studium inhibice multimerizace retrovirálního kapsidového proteinu HIV-1
skos:notation	IAB4055202
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAB4055202/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAB4055202/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-09-26 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1723118
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	HIV-1-capsid-protein; dimerization; inhibition; GFP; histidine-tag (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2004
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2005
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2005
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02002-AB
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Purifikované proteiny HIV-1 CA s N-koncovou fúzní značkou (His6, GST-GFP, biotin) byly použity pro vývoj metody testování inhibitorů dimerizace. V sekvenci CA dvou retrovirů bylo nalezeno a charakterizováno nové štěpné místo pro retrovirovou proteasu. (cs) Purified HIV capsid (CA) protein N-terminally fused to His6, GST-GFP or biotin was used to develop a method for testing of inhibition of CA dimerization. New target site for HIV protease was found and characterized within the CA sequence. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	GFP inhibition dimerization HIV-1-capsid-protein
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Specific in vitro cleavage of Mason-Pfizer monkey virus capsid protein: evidence for a potential role of retroviral protease in early stages of infection.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055202/2002/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055202/2003/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055202/2004/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055202/2005/ico%3A61388963

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software