About: Application of combinatorial libraries of affinity carriers for the identificatio of new interactions of the protein-ligand type

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Application of combinatorial libraries of affinity carriers for the identificatio of new interactions of the protein-ligand type Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAB4055003
Description	We propose a new method for the idetification of unknown interactions between a variety of proteins and ligands. The principe of the method is based on the interaction of mixtures of immobilized ligands (arrays of affinity carriers) with a mixture proteins occuring in crude homogenates from mammalian tissues. We intend to prepare combinatorial libraries of immobilized phosphinic pseudopeptides which will be used for the affinity binding of specific proteins. The bound proteins will be eluted and analyzed. The subsequent iterative process (the chemical synthesis of sublibraries) should lead to the identification of the unique ligand for the selected protein. Ideally, This ligand will be a potent and selective modulator of the respective protein function. No previous information about the nature of the protein is needed for the identification of the protein-ligand interaction. This procedure should be also a tool for the isolation of previously unknown proteins. (en) Navrhujeme novou metodu pro identifikaci nových doposud neznámých interakcí mezi různorodými proteiny a ligandy. Princip metody je založen na interakci směsí imobilizovaných ligandů (řady afinitních nosičů) se směsmi proteinů přítomných v surových homogenátech ze savčích tkání. Zamýšlíme připravit kombinatorické knihovny imobilizovaných fosfinových pseudopeptidů, které budou použity pro afinitní vázání specifických proteinů. Navázané proteiny budou eluovány a analyzovány. Následovný iterativní proces (chemická syntéza podknihoven) by měl vést k identifikaci jedinečného ligandu pro vybraný protein. Tento ligand by měl být, v ideálním případě, potentním a selektivním modulátorem funkce daného proteinu. Pro identifikaci interakce protein-ligand tak není potřebná žádná předchozí informace o charakteru daného proteinu. Tato metoda může být rovněž nástrojem pro isolaci proteinu nového, doposud neznámého.
Title	Application of combinatorial libraries of affinity carriers for the identificatio of new interactions of the protein-ligand type (en) Použití kombinatorických knihoven afinitních nosičů za účelem identifikace nových interakcí typu protein-ligand
skos:notation	IAB4055003
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAB4055003/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAB4055003/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2004-10-27 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1068708
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	affinity chromatography; proteomics; metalloprotein; transferase; inhibitor; phosphinate; peptide; combinatorial chemistry; (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2003
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2003
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV0-AB2000
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Podařilo se vyvinout novou metodu založenou na principu afinitní chromatografie sloužící k vyhledávání specifických proteinů pro ligandy připravené ve formě kombinatorických knihoven. Byly připraveny vysoce selektivní inhibitory lidského enzymu BHMT. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	affinity chromatography combinatorial chemistry inhibitor peptide proteomics metalloprotein phosphinate transferase
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Combining combinatorial chemistry and affinity chromatography: highly selective inhibitors of human betaine:homocysteine S-methyltransferase. Analysis and characterization of phosphinic pseudopeptides by capillary zone electrophoresis. Determination of dissociation constant of phosphinate group in phosphinic pseudopeptides by capillary zone electrophoresis. Analysis and characterization of phosphinic pseudopeptides by capillary zone electrophoresis. Betaine-homocysteine methyltransferase: zinc in a distorted barrel. Combining combinatorial chemistry and affinity chromatography for systematically probing protein-ligand interactions: application to the development of highly selective inhibitors of human betaine: homocysteine S -methyltransferase. Physicochemical characterization of phosphinic pseudopeptides by capillary zone electrophoresis in highly acidic background electrolytes. Development of novel inhibitors of Zn-metalloenzyme betaine: homocysteine S -methyltransferase. Separation of diastereomers of phosphinic pseudopeptides by capillary zone electrophoresis and reverse phase high-performance liquid chromatography.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055003/2000/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055003/2001/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055003/2002/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAB4055003/2003/ico%3A61388963

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software