About: Proteome dynamics in response to increased cytokinin levels in Arabidopsis

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Proteome dynamics in response to increased cytokinin levels in Arabidopsis Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA600040701
Description	Cytokinins (CKs) are known to act in combination with other plant hormones to regulate diverse developmental processes in plants. The exact molecular mechanisms of CK action in regulation of plant development are the subject of intense current research. While genome expression profiling of CK action has already been initiated by other groups elsewhere, here we propose to analyze proteome dynamics in response to increased CK levels in Arabidopsis under conditions similar to those used in monitoring genome-wide changes in gene expression. This will allow, for the first time, a comparison of the transcriptome and proteome data on highly comparable samples. Increase in CK levels will be achieved by treatment with exogenous CKs and by employing a novel dexamethasone-inducible gene expression system pOp/LhGR. A direct comparison of effects of three distinct CK classes is expected to contribute to elucidation of their individual function(s) in regulation of plant development. (en) Cytokininy (CK) se podílejí, v interakci s dalšími rostlinnými hormony, na regulaci řady vývojových procesů u rostlin. Přesné molekulární mechanizmy působení CK v regulaci vývoje rostlin jsou v současnosti předmětem intenzivního výzkumu. Zatímco analýza profilů exprese genomu v průběhu působení CK byla již započata jinými skupinami, zde navrhujeme analyzovat dynamiku proteomu v odpovědi na zvýšení hladin CK u Arabidopsis za podmínek podobných těm, které byly použity dříve při sledování změn v genové expresi na úrovni celého genomu. To nám umožní provést první srovnání údajů popisujících transkriptom a proteom u vysoce podobných vzorků. Zvýšení hladin CK bude dosaženo působením exogenních CK a využitím nového systému genové exprese indukovatelné dexametazonem – pOp/LhGR. Lze očekávat, že přímé srovnání účinků tří odlišných tříd CK přispěje k objasnění jejich individuálních funkcí v regulaci vývoje rostlin.
Title	Proteome dynamics in response to increased cytokinin levels in Arabidopsis (en) Dynamika proteomu v odpovědi na zvýšené hladiny cytokininů u Arabidopsis
skos:notation	IAA600040701
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA600040701/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA600040701/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2013-06-28 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82430043
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EF - Botanika
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	cytokinins; proteome; protein phosphorylation; Arabidopsis; dexamethasone-inducible gene expression system; 2-D protein electrophoresis; MALDI-TOF/TOF MS (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Agronomická fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	3 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	13 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	13 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-03-09 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/IAA600040701
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02007-A
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie ED - Fyziologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Cytokinin response proteins and phosphoproteins of Arabidopsis seedlings were identified, and their dynamics in response to increased cytokinin levels was characterized at standard and decreased intensity of white light. (en) Byly identifikovány proteiny a fosfoproteiny regulované cytokininy u semenáčků Arabidopsis. Byla charakterizována dynamika jejich změn v odpovědi na zvýšené hladiny cytokininů za standardní a snížené intenzity světla. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	cytokinins 2-D protein electrophoresis Arabidopsis dexamethasone-inducible gene expression system protein phosphorylation proteome
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	The combination of lectin affinity chromatography, gel electrophoresis and mass spectrometry in the study of plant glycoproteome: Preliminary insights Early cytokinin response proteins and phosphoproteins of Arabidopsis thaliana identified by proteome and phosphoproteome profiling Modulation of cytokinin action by decreased intensity of white light in Arabidopsis - a proteomic analysis Rapid and efficient protein enzymatic digestion: An experimental comparison Early cytokinin response proteins and phosphoproteins of Arabidopsis thaliana identified by proteome and phosphoproteome profiling Metody analýzy proteomu ve studiu hormonálních regulací rostlin Komparace 2D elektroforetických přístupů pro sledování proteomického profilování rostlin Využití moderních proteomických metod ve výzkumu rostlin A new approach to protein enzymatic digestion for fast protein identification by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry The combination of simple MALDI matrices for the improvement of intact glycoproteins and glycans analysis Cytokinin-induced photomorphogenesis in dark-grown Arabidopsis: a proteomic analysis Modulace odpovědi proteomu na teplotní stres v transgenních rostlinách Arabidopsis thaliana s indukovaně zvýšenými hladinami endogenních cytokininů Early cytokinin response proteins and phosphoproteins of Arabidopsis thaliana identified by proteome and phosphoproteome profiling
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2007/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2007/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2007/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2008/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2008/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2008/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2008/orjk%3A43210 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2009/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2009/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2009/orjk%3A43210 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2010/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2010/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2010/orjk%3A43210 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2011/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2011/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2011/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA600040701/2011/orjk%3A43210

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software