About: Interfacial and electrochemical behavior of synthetic oligonucleotides: effects of nucleotide sequence, conformation and chemical modification

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Interfacial and electrochemical behavior of synthetic oligonucleotides: effects of nucleotide sequence, conformation and chemical modification Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA400040903
Description	The project is focused on study of interfacial and electrochemical properties of synthetic oligonucleotides (ON) with respect to their nucleotide sequence, secondary structure and chemical modification. We will study in detail the relations between the ON primary structure, their interactions with electrically charged surfaces and electroactivity of the base residues. Behavior ONs adopting different secondary structures at electrodes (adsorption/desorption properties, accessibility of nucleobases to electrochemical reduction/oxidation, and potential-induced structural changes at the electrode surface) will be investigated. Similarly, chemically modified ONs (e.g.,involving alkylated bases or metal adducts) will be studied. The properties of DNA ONs will be compared with RNA and/or with other synthetic nucleic acids analogues. We expect that results of this project will contribute to understanding of the ON behavior at electrodes and will be utilized in development of novel DNA sensors. (en) Projekt je zaměřen na systematické studium mezifázových a elektrochemických vlastností syntetických oligonukleotidů (ON) s ohledem na jejich nukleotidovou sekvenci, sekundární strukturu a chemickou modifikaci. Detailně bude studován vztah mezi primární strukturou ON, jejich interakcemi s elektricky nabitými povrchy a elektrochemickou aktivitou zbytků bází. Budou navrženy ON vytvářející různé sekundární struktury a bude zkoumáno jejich chování na elektrodách, zejména adsorpčně-desorpční vlastnosti, přístupnost bází elektrochemické redukci/oxidaci a změny struktury na povrchu elektrody pod vlivem vloženého potenciálu. Podobně budou zkoumány chemicky modifikované ON (např. obsahujících alkylované báze, nebo adukty s komplexy kovů). Vlastnosti DNA oligonukleotidů budou porovnány s RNA a případně s dalšími syntetickými analogy nukleových kyselin. Předpokládáme, že výsledky projektu přispějí k detailnímu pochopení chování ON na elektrodách a budou využity při vývoji nových DNA senzorů.
Title	Interfacial and electrochemical behavior of synthetic oligonucleotides: effects of nucleotide sequence, conformation and chemical modification (en) Mezifázové a elektrochemické chování syntetických oligonukleotidů: vliv nukleotidové sekvence, konformace a chemické modifikace
skos:notation	IAA400040903
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA400040903/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA400040903/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2013-06-28 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	91838094
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CG - Elektrochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	oligonucleotides; DNA conformation; alternative DNA structures; chemical modofication of DNA; interfacial behavior; electrochemical methods; mercury electrodes; carbon electrodes; alternative DNA structures (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2011-03-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/IAA400040903
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2011
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2012
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02009-A
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2011-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2009-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	It was found, that formation of DNA alternative structures affect interfacial and electrochemical behavior of ODN adopting these structures. Methods were introduced for analysis of DNA modification by Pt complexes and for detection of unpaired T in DNA. (en) Bylo zjištěno, že tvorba některých alternativních struktur DNA silně ovlivňuje mezifázové a elektrochemické chování ODN tyto struktury tvořících. Byly zavedeny nové metody pro analýzu modifikace DNA komplexy platiny a pro detekci nespárovaných T v DNA. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	oligonucleotides DNA conformation alternative DNA structures carbon electrodes chemical modofication of DNA electrochemical methods interfacial behavior mercury electrodes
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Osmium tetroxide complexes as versatile tools for structure probing and electrochemical analysis of biopolymers Sensing mispaired thymines in DNA heteroduplexes using an electroactive osmium marker: towards electrochemical SNP probing Redox labels and indicators based on transition metals and organic electroactive moieties for electrochemical nucleic acids sensing
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040903/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040903/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040903/2011/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA400040903/2012/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software