About: Structure and function of the Trypanosoma brucei guide RNA binding protein 21 and its complex with the guide RNA molecule

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Structure and function of the Trypanosoma brucei guide RNA binding protein 21 and its complex with the guide RNA molecule Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP204/04/P191
Description	Trypanosoma brucei is the etiological agent of lethal African sleeping sickness. It annually affects millions of people and their domestic animals and no suitable treatment protocol is available. T. brucei is characterized by plethora of unique features including a uridine deletion/insertion type of RNA editing. This process, which is essential for the pathogen, does not exist in the metazoan host. Targeting of individual steps of the RNA editing process has, therefore, a potential to be an efficient way of treatment of the sleeping sickness. This proposal is aiming to study mechanism of recognition and binding of the guide RNA (gRNA) molecules to guide-RNA binding protein 21 (gBP21). gBP proteins stimulate annealing of pre-mRNA to gRNA, which servesas template for site-specific insertions and deletions of the uridine nucleotides into otherwise non-translatable mRNA molecules. From this point of view, gRNA-gBP21 interaction represents fundamental process for proper RNA editing. We will use (en) Trypanosoma brucei je parazitický prvok způsobující africkou spavou nemoc, která každoročně postihuje několik milionů lidí a jejich dobytek. V současné době není znám žádný účinný způsob léčby. T. brucei je primitivní eukaryot s celou řadou unikátních vlastností, mezi které mimo jiné patří atypické editování mitochondriální mRNA spojené s vystřiháváním a začleňováním uridinů do pre-mRNA. Tento komplexní, mnohastupňový proces je nepostradatelný pro udržení životních funkcí T. brucei. Jelikož se v hostitelských buňkách podobný proces nevyskytuje, představuje editování mitochondriální mRNA ideální cíl pro řízenou léčbu spavé nemoci. V rámci navrženého projektu budeme studovat jeden z počátečních a klíčových procesů editovaní mRNA, kterým je mechanismus rozpoznávání a vazby guide RNA (gRNA) s gRNA vážícím proteinem gBP21. gBP21 katalyzuje vazbu mezi pre-mRNA a gRNA, která slouží jako vzor pro vystřihávání a včleňování uridinů do jinak translačním aparátem nepřeložitelné pre-mRNA. S pomocí
Title	Structure and function of the Trypanosoma brucei guide RNA binding protein 21 and its complex with the guide RNA molecule (en) Studium vztahu mezi strukturou proteinu gBP21 a gRNA a jejich funkcí při editování RNA u Trypanosoma brucei
skos:notation	GP204/04/P191
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP204%2F04%2FP191/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP204%2F04%2FP191/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-10-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	2498042
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2006
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2004
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2007
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02004GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Cílem předloženého projektu je strukturní charakterizace proteinového komplexu MRP1/MPR2 z Trypanosoma brucei a určení jeho role v procesu editování RNA. Za nativních podmínek jsme izolovali MRP1 z T. Brucei. Následná analýza ukázala, že MRP1 za podmínek (cs) The project aims at structural characterization of the MRP1/MRP2 complex from T. brucei and assessment of its role in RNA editting. Under native conditions we isolated MRP1 from T. brucei. Subsequent analysis revealed that MRP1 under in vivo conditions f (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Structure and function of the native and recombinant mitochondrial MRP1/MRP2 complex from Crystal structures of Trypanosoma brucei MRP1/MRP2 guide-RNA binding complex reveal RNA matchmaking mechanism
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP204%2F04%2FP191/2004/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP204%2F04%2FP191/2005/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP204%2F04%2FP191/2006/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP204%2F04%2FP191/2007/orjk%3A12310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software