About: Novel flavin-dependent enzymes of Paracoccus denitrificans: reaction mechanisms, metabolic functions and their role in cellular oxidative stress

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Novel flavin-dependent enzymes of Paracoccus denitrificans: reaction mechanisms, metabolic functions and their role in cellular oxidative stress Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP503/12/0369
Description	The project deals with two enzymes, flavin reductase FerA and quinone reductase FerB, coupled with generation and/or managing oxidative stress in the bacterium Paracoccus denitrificans, often called “a free living mitochondrion”. The gene for the FerA will be isolated and the prepared corresponding recombinant protein will be characterized enzymologically, by X-ray crystallography and by site-directed mutagenesis. It will be determined whether FerA acts alone or in combination with other proteins. Production of superoxide by FerB will be quantified in in vitro experiments and the hypothesis will be tested that FerB is able to reduce the membrane bound ubiquinone. Wild-type strain and strains lacking or overproducing FerA and FerB will be compared for the degree of membrane lipid peroxidation. Proteomic analysis of cells exposed to redox stressors will help to identify redox regulon members. (en) Projekt se zabývá dvěma enzymy, flavin reduktasou FerA a chinonreduktasou FerB, spojenými s generováním nebo zvládáním oxidačního stresu u bakterie Paracoccus denitrificans, často nazývané “volně žijící mitochondrie”. Bude izolován gen pro FerA a připravený odpovídající rekombinantní protein bude charakterizován enzymologicky, krystalograficky a pomocí místně řízené mutageneze. Bude stanoveno, zda FerA působí samostatně nebo v kombinaci s dalšími proteiny. V pokusech in vitro bude kvantifikována produkce superoxidu enzymem FerB a testována hypotéza, že FerB je schopen redukovat membránový ubichinon. U divokého kmene a mutantních kmenů bez FerA resp. FerB nebo s jejich zvýšenou produkcí bude porovnán stupeň peroxidace membránových lipidů. Proteomická analýza buněk vystavených redoxním stresorům pomůže při identifikaci členů redoxního regulonu.
Title	Novel flavin-dependent enzymes of Paracoccus denitrificans: reaction mechanisms, metabolic functions and their role in cellular oxidative stress (en) Nové flavin-dependentní enzymy Paracoccus denitrificans: reakční mechanismy, metabolické funkce a úloha v buněčném oxidačním stresu
skos:notation	GAP503/12/0369
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP503%2F12%2F0369/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP503%2F12%2F0369/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100782030
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	oxidative stress superoxide flavin reductase quinone reductase ubiquinone protein crystallography (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P503-12-0369
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBK
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	The Structural and Functional Basis of Catalysis Mediated by NAD(P)H:acceptor Oxidoreductase (FerB) of Paracoccus denitrificans
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0369/2012/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0369/2013/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0369/2014/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0369/2015/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 118 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software