About: Immune response genes in the horse

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Immune response genes in the horse Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA523/99/1152
Description	Genes known to be involved in immune responses in other species will be studied in the horse. Primers specific for different parts of such genes (exons, introns, promoters, 3´UTR) will be designed in order to amplify potentially polymorphic sites. PCR protocols will be set-up for each pair of primers, and the corresponding region will be amplified, sub-cloned into an appropriate vector and the clones will be sequenced. Based on the sequences determined, an attempt to set-up a typing method (e.g. RFLPor SSCP) will be done. Three types of genes are supposed to be analysed. for genes, whose sequence are unknown, and whose existence in the horse is assumed, like Nramp1 and iNOS, the primers are expected to be designed based on homologous sequences from other, especially closely related species. Genes whose sequences have been determined in the horse without reporting on their polymorphism, like TNF-alpha, will be amplified by using horse-specific primers designed from the GenBank sequence. Out of genes (en) Projekt je příspěvkem k celosvětovému programu mapování genomu koně. Zaměřuje se na studium polymorfismu genů, které hrají úlohu v genetické determinaci imunitní odpovídavosti koně. U každého genu budou určeny primery vymezující jednu nebo více jeho oblastí (promotorů, exonů intronů, 3´UTR) se zaměřením na místa předpokládaného polymorfismu, bude optimalizován PCR protokol, amplifikované produkty budou subklonovány a jednotlivé klony sekvenovány. Na základě znalosti sekvencí bude učiněn pokus o vypracování typizační metody, např. RFLP nebo SSCP. Analyzovány budou tři kategorie těchto genů. U genů, jejichž sekvence není u koní známa (Nramp 1, iNOS) budou primery určeny na základě homologie s jinými, zejména příbuznými druhy. U genů, jejichž sekvence je u koní známa, ale kde dosud nebyl popsán polymorfismus (TNF-alfa), budou určeny specifické primery. Z genů, jejichž polymorfismus byl u koní popsán, se pozornost soustředí na gen ELA-DQB, u nějž byly specifické primery pro druhý exon designov
Title	Immune response genes in the horse (en) Studium některých genů imunitní odpovídavosti koně
skos:notation	GA523/99/1152
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA523%2F99%2F1152/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA523%2F99%2F1152/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2003-04-01 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	739724
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	GI - Šlechtění a plemenářství hospodářských zvířat
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fakulta veterinárního lékařství
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2002
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2002
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
http://linked.open...jektu+dodavatelem	1. Nově byl zjištěn polymorfismus u 8 genů imunitní odpovědi. Nově byl u koně identifikován gen NRAMP1, byla stanovena kompletní kódující nukleotidová sekvence cDNA, charakterizována genomická organizace a gen byl mapován na 6. Chromozómech metodou FISH. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Two bi-allelic single nucleotide polymorphism within the promoter region of the horse tumor necrosis factor alfa gene Polymorphisms in equine immune response genes and their associations with infections A second locus and new alleles in the major histocompatibility complex class II (ELA-DQB) region in the horse Characterization of the NRAMP1 (SLC11A1) gene in the horse (Equus caballus) Biologický princip chemoterapie: reakce buňky jako výsledek její evoluční paměti Dog and cat diseases in specific periods of life
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F99%2F1152/1999/orjk%3A16170 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F99%2F1152/2000/orjk%3A16170 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F99%2F1152/2001/orjk%3A16170 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F99%2F1152/2002/orjk%3A16170

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software