| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - Comparative analysis of the immunogenome of the family Equidae in the context of host-pathogen interactions will be performed. Allelic sequence diversity, evolution and balancing selection of the MHC DRB, DQB genes and of the KIR/Ly49 genes, encoding natural killer cell receptors will be analyzed in zebras, asses and donkeys. Furthermore, comparative analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in selected immunity-related genes will be performed in various species of zebras, asses and in two populations of domestic donkeys. Genes showing across-breed associations with virus (West Nile virus), bacterial (Rhodococcus equi) and protozoan (Trypanosoma evansi) infections will be selected for analysis. Horse-specific primers will be used for amplifying the corresponding orthologues in other equid species. The PCR products will be cloned and sequenced. SNPs identified will be used for evaluating the extent of genetic diversity and evolutionary relationships of various Equids. Chromosome evolution of Equidae with special focus on chromosome microrearrangements will be investigated. (en)
- Cílem projektu je srovnávací analýza imunogenomu čeledi Equidae v kontextu interakcí hostitele a patogena. Na základě určení sekvenční alelické diversity genů MHC DRB a DQB a dvou rodin genů kódujících receptory NK buněk KIR/Ly49 bude provedena evoluční analýza u různých druhů zeber, velkých oslů a domácích oslů z Itálie a Keni, dále bude zkoumán vliv balancované selekce na specifická aminokyselinová místa. Polymorfismus genů imunitní odpovědi, které jsou nejméně u dvou plemen koní asociovány s resistencí k virové (virus západonilské horečky), bakteriální (Rhodococcus equi) a protozoární (Trypanosoma evansi) infekci bude analyzován za využití koňských primerů u různých příslušníků čeledi Equidae. PCR produkty budou klonovány, sekvenovány a budou v nich identifikovány jednonukleotidové polymorfismy (SNP). Data budou využita pro určení stupně genetické diversity různých populací a pro určení evolučních vztahů mezi druhy. Evoluce chromosomů se zvláštním zřetelem na mikropřestavby při speciaci bude zkoumána za využití metod molekulární cytogenetiky.
|
| Title
| - Comparative immunogenomics of the family Equidae (en)
- Komparativní imunogenomika čeledi Equidae
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - Immunity-related; genes; MHC; KIR/Ly49; SNP; FISH; horse; Equids; evolution (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Detailed mapping of the immunogenome of the family Equidae, as well as genome wide comparative maps of some subchromosomal rearangements. Association between polymorphic markers of selected immune genes and some protozoan parasites. Diagnostic assays for these parasites were also developed. Altogether 5 papers have been published in journals with an average impact within the particular branch. (en)
- Podrobné mapování imunogenomu čeledi Equidae, zároveň s celogenomovým srovnávacím mapováním některých subchromosomálních přestaveb. Asociace mezi polymorfními markery vybraných genů imunitní odpovědi a některých protozoarních parazitů. Také byly vytvořeny diagnostické testy pro detekci těchto parazitů. Celkem bylo publikováno 5 článků v časopisech s průměrným impaktem v rámci oboru. (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - Equids
- FISH
- KIR/Ly49
- MHC
- SNP
- genes
- horse
- Immunity-related
|
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)