We suggest to study the impact of protozoan as one of the principal forces shaping microbial species diversity in aquatic microbial assemblages. Impact of protozoan grazing on genotypic and phenotypic characteristics of bacterial assemblages will be studied at the beginning in laboratory systems with increasing complexity and then in pelagic environments byusing a combination of two modern approaches: fluorescent rRna-targeted oligonucleotide probes and image analysis. The project should address the question whether frequently observed changes in morphology and physiology of bacteria under protozoan grazing pressure are linked only to adaptive mechanisms of a respective bacterial strain (i.e. phenotypic plasticity) or whether protozoan bacterivory causes the real shifts in genotypic diversity of bacterial assemblages. Further the project should enable to find general trends between genotypic diversity and physiological state of bacterial assemblages under changing protozoan grazing pressure. (en)
Intenzivní konzumace bakterií prvoky je dnes považována za nejdůležitější faktor regulující morfologické a fyziologické charakteristiky bakteriálních společenstev ve vodě (tj. velikost,metabolická a růstová aktivita buněk).Cílem navrhovaného projektu jestudium změn bakteriálních společenstev indukovaných predačním tlakem prvoků.Posuny v celém spektru bakteriálních kmenů v přírodních společenstvech jako důsledek predace nebyly doposud studovány,především z důvodů obtížné kultivovatelnosti těchto mikro organismů.V tomto projektu bude využita kombinace dvou moderních metodických přístupů nevyžadujících kultivaci tj. fluorescenčně značených oligonukleotidových RNA-sond a analýzy obrazu,a to jak v experimentálních systémech o různé složitosti, tak i v přírodním planktonu. Projekt by měl odpovědět na otázku, zda pozorované změny jsou vázány pouze na adaptační mechanismy jednotlivých kmenů (tj. fenotypickou plasticidu),nebo zda jsou jejich pozadím skutečné posuny v genetické struktuře studovaných společens
Bylo prokázáno, že při déletrvajícímu predačnímu tlaku prvoků dochází nejen k výrazným morfologickým posunům v bakteriálních společenstvech, ale ty byly provázeny také výraznými změnami v zastoupení jednotlivých podskupin Eubacteria. Řešitelský tým spolu (cs)