Potential energy surface of small amino acids will be studied using ab initio quantum chemical methods covering corelation energy. Entropy and free energy will be determined using rigid rotor - harmonic oscillator approximations. Ab initio surface will be used for reparametrisation and/or design of empirical potential. This potential will be used in computer simulations of free energy surfaces of amino acids studied. Verification of potential found will be done by comparing calculated vibration frequencies, ionization potentials and electron affinities of selected amino acids with the respective experimental values obtained from photoelectron spectroscopy. Potential obtained will be used for generating potential energy and free energy surfaces of peptides. (en)
Povrchy potenciální energie malých aminokyselin budou určeny pomocí ab initio kvantověmechanických výpočtů zahrnujících korelační energii. V energetických minimech bude metodami teoretické chemie určena entropie a volná energie. Ab initio povrchy potenciální energie poslouží k reparametrizaci, případně designu empirického potenciálu. Tento potenciál bude užit v počítačových simulacích povrchu volné energie různých aminokyselin. Verifikace potenciálu i teoretických procedur bude provedena srovnánívypočtených veličin (vibrační frekvence, ionizační potenciály, elektronové afinity) s pokusnými údaji určenými fotoelektronovou spektroskopií. Získaný potenciál bude užit pro výpočty potenciální a volné energie malých peptidů.
Odborný přínos projektu je vysoký. Údaje v závěrečné kartě jsou adekvátní. Výsledky projektu budou dále využity v dalších projektech základního výzkumu. Publikační činnost je na vysoké úrovni. Drobné nedostatky v čerpání jednotlivých položek u spoluřešit (cs)