Cílem tohoto projektu, jehož řešení je plánováno na dva roky, je vytvoření uživatelsky jednoduchého a cenově dostupného počítačového programu, který by umožňoval automatizovanou analýzu buněčné granularity a vnitrobuněčného pH. Jeho funkčnost bude testována a ověřována na mikroskopických obrazech kvasinek. K vytvoření podkladů pro vyhodnocování funkčnosti navrhovaných modulů budou použity mikroskopické snímky distribuce fluorescenčně značených proteinů v kvasinkách reagujících v čase na různé podmínky stresu. Různé stupně granularity a pH cytoplazmy budou charakterizovány ve srovnávacích pokusech pomocí různých markerů stresových granulí či obecných stresů vedoucích ke změnám vnitrobuněčného pH. Vytvořený program by se měl stát základem jednoduché metodiky vyhodnocování působení fyzikálních stresů a různých xenobiotik na eukaryotickou buňku. (cs)
The aim of this project is to produce a user-friendly and low-cost software enabling automated analysis of cell granularity and intracellular pH. The SW function will be tested and validated on microscopy images of yeast cells. To create a basis for evaluation of function of SW modules, microscopy images of distribution of fluorescent-tag-labelled proteins in yeast cells in response to various stresses will be used. Different levels of granularity and diffused fluorescence will be characterized in parallel experiments using various markers of stress granules or stress conditions inducing changes of intracellular pH. Resulting software would represent a basis for a straightforward and easy methodology of evaluation of influence of various stress conditions and different xenobiotics on a eukaryotic cell. (en)