About: Structural and functional characterization of the giant plant Ogre-like retrotransposons

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Structural and functional characterization of the giant plant Ogre-like retrotransposons Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	The giant Ogre-like elements represent a novel family of recently amplified and transcriptionally active plant retrotransposons which appear to have a significant impact on genome evolution in many plant species. Besides their extreme length (22-25 kb) they are characterized by several unique structural features which suggest they constitute a distinct group of LTR-retroelements. This project aims at detailed characterization of the Ogre-like elements, which will include their transcription analysis and identification of regions regulating the transcription, investigation of their specific features (intron sequences and additional open reading frame), and comparative computer analysis of the elements from species belonging to different genera. These experiments will help to elucidate molecular mechanisms allowing efficient genomic amplification of these retroelements and their interaction with the host genomes. (en) Retrotranspozóny typu Ogre představují nově popsanou rodinu rostlinných retroelementů, pro kterou je charakteristická extrémní délka elementů (22-25 kb) a jejich specifická struktura. Tyto elementy vykazují v řadě studovaných druhů vysoký stupeň amplifikace a konzervovanosti svých sekvencí, a navíc jsou transkripčně aktivní, což naznačuje jejich recentní transpoziční aktivitu. Cílem navrhovaného projektu je provést detailní charakterizaci Ogre elementů, zaměřenou na variabilitu a strukturu jejich transkriptů a identifikaci odpovídajících regulačních sekvencí, studium čtecího rámce o neznámé funkci a srovnávací počítačovou analýzu elementů pocházejících z různých druhů. Výsledkem těchto analýz bude podrobná charakterizace Ogre elementů jako potenciálně nové skupiny rostlinných retrotranspozónů, a především příspěvek k objasnění molekulárních mechanismů umožňujících vysoce účinnou amplifikaci některých typů retrotranspozónů v genomech rostlin. (cs)
Title	Strukturní a funkční charakterizace gigantických rostlinných retrotranspozónů typu Ogre (cs) Structural and functional characterization of the giant plant Ogre-like retrotransposons (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/IAA500960702
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/36941649
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EB
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/IA
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SAV02007-A
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	retroelements; plant genome evolution; genome size; repetitive DNA (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/AV0
http://linked.open...avai/start-reseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	2272 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	2272 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	3 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	3 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2007/IAA500960702/ico-60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2008/IAA500960702/ico-60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2009/IAA500960702/ico-60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2010/IAA500960702/ico-60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software