Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
Description
| - Analysis of a single strand conformation polymorphism (SSCP) using capillary electrophoresis (CE) is a novel method to study polymorphism of DNA sequences in large scale population studies. We optimized CE-SSCP analysis to study the major histocompatibility complex (MHC) class II alpha gene (DQA) polymorphism. Short-chain linear polyacrylamide (6%) as sieving matrix, TrisCl (pH 8.5) as buffer for sample dilution, and 27 degrees C, 9 kV as electrophoresis parameters were suitable for sufficient resolution of all alleles. We found that almost 25% of clones contained a PCR (polymerase chain reaction) artefact and strict criteria have to be applied when using cloning and sequencing to analyse the allelic diversity of MHC genes.
- Analysis of a single strand conformation polymorphism (SSCP) using capillary electrophoresis (CE) is a novel method to study polymorphism of DNA sequences in large scale population studies. We optimized CE-SSCP analysis to study the major histocompatibility complex (MHC) class II alpha gene (DQA) polymorphism. Short-chain linear polyacrylamide (6%) as sieving matrix, TrisCl (pH 8.5) as buffer for sample dilution, and 27 degrees C, 9 kV as electrophoresis parameters were suitable for sufficient resolution of all alleles. We found that almost 25% of clones contained a PCR (polymerase chain reaction) artefact and strict criteria have to be applied when using cloning and sequencing to analyse the allelic diversity of MHC genes. (en)
- Kapilární elektroforéza SSCP je nová metoda studující polymorfismus DNA sekvencí zejména v populačně-genetických studiích. V práci je popisována optimalizace této metody při studiu polymorfismu genu DQA, který náleží mezi MHC geny skupiny II. Ideální podmínky kapilární elektroforézy, které umožnily odlišení téměř všech alel byly následující: SLPA jako dělící polymer, TrisCl (pH 8,5) jako pufr pro ředění vzorku a 27°C a 9 kV jako parametry elektroforézy. Zároveň jsme zjistili, že téměř 25% všech analyzovaných klonů obsahovalo PCR artefakt, proto by při analýzách MHC variability měla být uplatňována striktní kriteria pro identifikaci nových alel. (cs)
|
Title
| - Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism
- Analýza genu hlavního histokompatibilního komplexu třídy II u hryzce vodního použitím analýzy SSCP v kapiláře (cs)
- Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism (en)
|
skos:prefLabel
| - Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism
- Analýza genu hlavního histokompatibilního komplexu třídy II u hryzce vodního použitím analýzy SSCP v kapiláře (cs)
- Analysis of major histocompatibility complex class II gene in water voles using capillary electrophoresis-single stranded conformation polymorphism (en)
|
skos:notation
| - RIV/68081766:_____/05:00000406!RIV/2005/AV0/A67005/N
|
http://linked.open.../vavai/riv/strany
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
| |
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
http://linked.open...titaPredkladatele
| |
http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/68081766:_____/05:00000406
|
http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - water vole;population genetics (en)
|
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
http://linked.open...odStatuVydavatele
| - GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
|
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| |
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
http://linked.open...v/svazekPeriodika
| |
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Bryja, Josef
- Cosson, J.-F.
- Charbonnel, N.
- Galan, M.
|
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
| |
issn
| |
number of pages
| |