Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
Description
| - The manuscript deals with the method of two-dimensional differential gel electrophoresis (2D-DIGE) and its application in proteomics. First, the method of 2D-DIGE is characterised and compared to %22classical%22 denaturating 2-DE, especially 2D SDS-PAGE. The main focus is given on protein sample preparation, especially sample labelling with CyDyes fluorescent dyes. In addition, protein separation and subsequent detection of labelled protein is described. In conclusion, the main advatages (separation of two different protein samples plus an internal standard in one gel - reduction of inter-gel variability, avoiding problems with gel reproducibility) and disadvatages (higher costs on 2D-DIGE gels - costs on sample labelling with CyDyes, costs on fluorescent scanner for detection of protein spots labelled with CyDyes; minimal labelling - inability to detect proteins without lysine residues; saturation labelling - inability to detect proteins without cysteine residues) are discussed. (en)
- Příspěvek se zabývá popisem metody dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2D-DIGE) a možnostmi jejího využití v proteomice. Důraz je kladen zvláště na ty aspekty metody 2D-DIGE, které se odlišují od %22klasické%22 dvourozměrné denaturační elektroforézy (2D SDS-PAGE), tj. značení proteinových vzorků fluorescenčními barvivy CyDyes, dělení vzorků a detekce jednotlivých proteinových skvrn (spotů). V závěru jsou stručně shrnuty hlavní výhody a nevýhody metody 2D-DIGE (možnost současného rozdělení dvou různých vzorků v jednom gelu včetně interního standardu - alespoň částečná eliminace potíží s reproducibilitou gelů; vyšší pořizovací náklady na fluorescenční scanner pro detekci proteinů označených barvivy CyDyes; v případě tzv. minimálního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují lysin; v případě tzv. saturačního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují cystein).
- Příspěvek se zabývá popisem metody dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2D-DIGE) a možnostmi jejího využití v proteomice. Důraz je kladen zvláště na ty aspekty metody 2D-DIGE, které se odlišují od %22klasické%22 dvourozměrné denaturační elektroforézy (2D SDS-PAGE), tj. značení proteinových vzorků fluorescenčními barvivy CyDyes, dělení vzorků a detekce jednotlivých proteinových skvrn (spotů). V závěru jsou stručně shrnuty hlavní výhody a nevýhody metody 2D-DIGE (možnost současného rozdělení dvou různých vzorků v jednom gelu včetně interního standardu - alespoň částečná eliminace potíží s reproducibilitou gelů; vyšší pořizovací náklady na fluorescenční scanner pro detekci proteinů označených barvivy CyDyes; v případě tzv. minimálního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují lysin; v případě tzv. saturačního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují cystein). (cs)
|
Title
| - Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice
- The method of tvo-dimensional differential gel electrophoresis and its application in proteomics (en)
- Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice (cs)
|
skos:prefLabel
| - Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice
- The method of tvo-dimensional differential gel electrophoresis and its application in proteomics (en)
- Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice (cs)
|
skos:notation
| - RIV/00027006:_____/10:00001157!RIV11-GA0-00027006
|
http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivity
| - P(GP522/09/P621), P(OC08066), Z(MZE0002700604)
|
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
| |
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
http://linked.open...titaPredkladatele
| |
http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/00027006:_____/10:00001157
|
http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - 2D-DIGE; CyDyes fluorescent dyes; quantitative protein evaluation; proteomics (en)
|
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
http://linked.open...odStatuVydavatele
| |
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| |
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
http://linked.open...v/svazekPeriodika
| |
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Kosová, Klára
- Prášil, Ilja
- Vítámvás, Pavel
- Škodáček, Zbyněk
|
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
| |
issn
| |
number of pages
| |