About: Sex chromosomes and dynamics of transposable elements     Goto   Sponge   Distinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • The existence and evolution of sex chromosomes is a basic question in evolutionary biology. The Y chromosome is a bizarre part of the genomes, non-recombining, what results in its degeneration and accumulation of repetitive DNA, mostly transposable elements. We will study dynamics of transposable elements on young sex chromosomes of dioecious plant Silene latifolia. First, we will characterize all abundant repetitive elements using our recent 454 sequencing data. Comparison of male and female genomes will reveal elements accumulated on the Y chromosome, what will be confirmed by FISH mapping. Comparison of transposable elements amplified on microdissected sex chromosomes combined with studies of their expression patterns will enable us to decide how active are elements on the sex chromosomes. Together with identification of transposable elements within genes on degenerating Y chromosome and determination of their age give us a detailed picture of the role of transposable elements in shaping genomic and transcriptomic landscape of the young degenerating Y chromosome. (en)
  • Vznik a evoluce pohlavních chromosomů je jednou ze základních otázek evoluční biologie. Unikátní je především chromosom Y, představující zvláštní část genomu, která nerekombinuje. Výsledkem je jeho degenerace a akumulace repetitivní DNA, zejména transposonů. Budeme studovat dynamiku transposonů u mladých pohlavních chromosomů dvoudomé rostliny Silene latifolia. S použitím našich recentních dat z 454 sekvenování budeme nejprve charakterizovat hlavní repetitivní elementy. Srovnáním samčího a samičího genomu odhalíme elementy akumulované na chromosomu Y, což bude ověřeno pomocí FISH. Porovnání transposonů amplifikovaných na mikrodisektovaných chromosomech, v kombinaci se sledováním jejich exprese, nám umožní zjistit, jak aktivní jsou elementy nacházející se na pohlavních chromosomech. To nám pak spolu s identifikací transposonů v genech na degenerujícím chromosomu Y, a určením jejich stáří, poskytne podrobný obrázek úlohy transposonů ve formování genomové a transkriptomové krajiny mladého degenerujících chromosomu Y. Grant je pokračováním grantu GAČR 204/05/2097.
Title
  • Sex chromosomes and dynamics of transposable elements (en)
  • Pohlavní chromosomy a dynamika transposonů
skos:notation
  • GAP305/10/0930
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • sex chromosomes transposable elements expression degeneration (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • The results of this project enhanced in a significant manner our knowledge of the evolution of sex chromosomes and the behaviour of dynamic components of plant genomes - transposons, microsatellites and promiscuous DNA. These data were published in 14 papers and one monograph chapter. (en)
  • Výsledky tohoto projektu zásadním způsobem rozšířily naše znalosti o evoluci pohlavních chromozomů a o chování dynamických složek rostlinných genomů – transposonů, mikrosatelitů a promiskuitní DNA. Tato data byla publikována ve 14 článcích a jedné kapitole v zahraniční monografii. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 82 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software