About: Deep phylogeny of anaerobic fungi

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Deep phylogeny of anaerobic fungi Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA523/05/2555
Description	Gut fungi are strictly anaerobic microorganisms occupying forestomach of ruminants and digestion tract of some herbivores. Anaerobic fungi were classified on the base of morphological characters as class Chytridiomycetes, order Spizellomycetales and family Neocallimasticacea. However anaerobic fungi possess many unique features like are anaerobiosis, multiple flagella, lack of mitochondria, hydrogen-generating hydrogenosomes and extremely low genomic G+C content, which do not correspond with characters of Chytridiomycetes. Inside the family Neocallimasticacea 5 genera, two polycentric Orpinomyces and Anaeromyces and three monocentric Piromyces, Ceacomyces, Neocallimastix have been classified also according to morphological traits. However molecular approach based on rDNA sequences does not reflect morphological differences used for traditional classification. Phylogenetic analyses based up to now exclusively on analysis of rDNA sequences have shown that separation of gut fungi to (en) Anaerobní houby osidlují bachor přežvýkavců a tlusté střevo některých býložravců. Na základě morfologických charakteristik byly taxonomicky zařazeny do třídy Chytridiomycet, řádu Spizellomycetales a čeledi Neocallimasticacea. Bachorové houby však vykazují řadu vlastností jako je anaerobióza, mnohočetnost bičíků, nepřítomnost mitochondrií a výskyt hydrogenosomů či extrémně nízké zastoupení G+C párů v genomu, jež jsou v příkrém rozporu s morfologickými rysy typickými pro Chytridiomycety. V rámci čeledi Neocallimasticacea bylo opět na základě morfologie popsáno 5 rodů, dva polycentrické Orpinomyces a Anaeromyces a tři monocentrické Piromyces, Caecomyces a Neocallimastix. Avšak metody molekulární biologie založené na sekvenční analýze úseků rDNA poukázaly na to, že dělení anaerobních hub na monocentrické a polycentrické není z hlediska genetického opodstatněné a dále prokázaly značnou heterogenitu některých rodů. Klasifikace anaerobních hub a vztahy mezi rody i v rámci řádu a třídy zůstávají
Title	Deep phylogeny of anaerobic fungi (en) Hloubková fylogeneze anaerobních hub
skos:notation	GA523/05/2555
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA523%2F05%2F2555/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA523%2F05%2F2555/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-12-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	71265368
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	anaerobic fungi; phylogenetic analysis; rDNA; actin; chitinase (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2007-05-02 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/523%2F05%2F2555
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2007
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2008
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02005GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2007-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie GH - Výživa hospodářských zvířat
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2005-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Project Deep phylogeny of anaerobic fungi resulted in extensive phylogenetic study of Neocallimasticaceae fungi inhabiting gastrointestinal tract of ruminants based on sequence analysis of ribosomal DNA and genes coding evolutionary important proteins - (en) Výsledkem projektu Hloubková fylogeneze anaerobních hub je rozsáhlá fylogenetická studie hub čeledi Neocallimasticaceae osidlujících zažívací trakt přežvýkavců založená na sekvenční analýze ribozomální DNA a genů kódujících evolučně významné proteiny, a (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	anaerobic fungi actin phylogenetic analysis rDNA
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F05%2F2555/2007/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F05%2F2555/2008/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F05%2F2555/2005/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA523%2F05%2F2555/2006/ico%3A67985904

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 78 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software