About: Barriers to gene flow for different parts of the mouse genome: an analysis of a house mouse hybrid zone with microsatellites, SINEs, and SNPs

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Barriers to gene flow for different parts of the mouse genome: an analysis of a house mouse hybrid zone with microsatellites, SINEs, and SNPs Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA206/03/0205
Description	The proposed project is focused on using microsatellites, SINE insertions, and SNPs in genetic mapping of the hybrid zone between house mice Mus musculus and M. domesticus. It is focused on following questions: How strong a barrier is the hybrid zone forthe gene flow between the two taxa, acting on different parts of the mouse genome? To what extent are wild populations structured? What is the individual dispersal range? For solving these problems, molecular markers will be employed mapping those partsof the genome which are supposed to play a role in impeding gene flow between the two mouse taxa (Hst1 on chromosome 17, HstX on the X, t haplotype, distal part of chrom. 19) and some autosomal markers as well. Even though the mouse genome is one of thebest studied animal genomes, studies of this extent and kind are not known: 1. Despite numbers of studies of mouse male sterility genes and t haplotype, studies of wild mice living both inside and outside the hybrid zone have not been carried out so far. (en) Navrhovaný projekt je zaměřen na využití mikrosatelitů, SINE inzercí a polymorfismu typu SNP (single nucleotide polymorphism) při genetickém mapování hybridní zóny mezi dvěma druhy myší, Mus musculus a M. domesticus. Cíle projektu jsou soustředěny nařešení následujících otázek: Jak silnou bariérou je hybridní zóna pro tok genů mezi oběma taxony v různých částech myšího genomu? Do jaké míry jsou volně žijící populace myší strukturovány? Jak velká je disperze jednotlivých myší? Pro řešení těchtoproblémů budou použity molekulární markery mapující především ty oblasti, o kterých se předpokládá, že hrají roli jakožto bariéry toku genů mezi oběma taxony myší (Hst1 na chr. 17, HstX na chr. X, t haplotyp, distální část chr. 19), doplněné o některédalší autozomální oblasti. Přestože myší genom patří k nejlépe prostudovaným mezi živočichy, studie v tomto rozsahu a zaměření dosud nejsou známy: 1. Přes množství studií věnovaných genům myší samčí sterility a t haplotypu, studie volně žijících myší z
Title	Barriers to gene flow for different parts of the mouse genome: an analysis of a house mouse hybrid zone with microsatellites, SINEs, and SNPs (en) Bariéry toku genů pro různé části myšího genomu: analýza hybridní zóny domácích myší pomocí mikrosatelitů, SINE a SNP
skos:notation	GA206/03/0205
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA206%2F03%2F0205/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA206%2F03%2F0205/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-01-15 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33435798
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02003GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EG - Zoologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Celkem bylo geneticky analyzováno více než 2000 myší ze 128 lokalit z 130x40 km transektu napříč myší hybridní zónou v Z Čechách a V Bavorsku. Analýzou mikrosatelitů byla stanovena míra strukturovanosti myších populací a disperze jedinců. Pomocí sady aut (cs) In total, more than 2000 mice were genetically analyzed from 128 sites scattered trhrough a 130x40 km transect across the mouse hybrid zone in W Bohemia and E Bavaria. Using a set of microsatellites the degree to which mouse populations are structured an (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2003/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2003/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2004/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2004/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2005/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2005/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2006/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2006/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2007/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F03%2F0205/2007/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software