About: Conjugates of nucleobases with metal complexes as electroactive markers. Application of labelled oligonucleotides in electrochemical DNA sensors

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Conjugates of nucleobases with metal complexes as electroactive markers. Application of labelled oligonucleotides in electrochemical DNA sensors Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/05/0043
Description	The project will deal with the synthesis of novel types of conjugates of purine and pyrimidine bases with metal complexes (e.g. ferrocene, transition metal complexes of bipyridine or phenanthroline etc.) connected by a conjugated linker. Such labelled nucleosides will be transformed to protected phosphoramidites and use in oligonucleotide synthesis. We will study electrochemical behaviour of the labelled oligonucleotides in their single-stranded as well as double-stranded forms (including duplexes involving single-base mismatches). The goal is to find a system whose electrochemical features will be significantly affected by the duplex formation. Such system will be utilized in development of sensors for DNA hybridization. We suppose that effects of interactions between base pairs in the DNA double helix will be transferred through the conjugated system to the marker (metal complex). Potential markers will be also studied by theoretical chemistry calculations and the calculated ionization (en) Projekt bude zaměřen na syntézu nových typů konjugátů purinových a pyrimidinových bází a nukleosidů s komplexy kovů (např. ferrocen, komplexy bipyridinu či fenanthrolinu s různými přechodnými kovy atd.) spojených přes konjugovaný linker. Takto označené nukleosidy budou převedeny na chráněné fosforamidity a použity v syntéze oligonukleotidů. Bude studováno elektrochemické chování značených oligonukletidů v jejich jednořetězcové a dvouřetězcové formě (včetně duplexů s řetězci obsahujícími bodové mutace).Cílem bude najít systém, jehož elektrochemické vlastnosti budou výrazně ovlivněny tvorbou duplexu DNA, a využít jej při vývoji senzorů pro hybridizaci DNA. Předpokládáme, že se vliv interakcí mezi páry bazí v dvoušroubovici DNA přenese přes konjugovaný systém na marker (komplex kovu). Potenciální markery budou také studovány teoretickými výpočetními metodami a vypočtené ionizační potenciály srovnávány s experimentálními daty. Výpočty budou využity při racionálním designu nových markerů.
Title	Conjugates of nucleobases with metal complexes as electroactive markers. Application of labelled oligonucleotides in electrochemical DNA sensors (en) Konjugáty nukleobází s komplexy kovů jako elektroaktivní značky. Využití značených oligonukleotidů v senzorech pro hybridizaci DNA
skos:notation	GA203/05/0043
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F05%2F0043/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F05%2F0043/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-12-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	71263189
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CC - Organická chemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	nucleobases; nucleotides; oligonucleotides; metal complexes; electrochemistry; sensors; DNA (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	15 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	15 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2007-05-02 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/203%2F05%2F0043
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2007
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2008
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02005GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2007-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CG - Elektrochemie EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2005-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Cíle projektu byly splněny a značně rozšířeny. Byla vypracována metodika arylací a alkynylací nukleobází a nukleosidů cross-coupling reakcemi a syntéza konjugátů nukleobází a nukleosidů s Ru a Os komplexy. Původní záměr připravovat značené oligonukleotid (cs) The goals of the project have been fulfilled and significantly extended. Methodology for arylation and alkynylation of nucleobases and nucleosides by cross-coupling reactions and synthesis of conjugates of nucleobases and nucleosides with Ru and Os compl (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	nucleobases electrochemistry metal complexes nucleotides oligonucleotides sensors
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2005/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2005/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2006/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2006/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2007/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2007/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2008/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0043/2008/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 84 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software