Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
rdfs:seeAlso
| |
Description
| - Recently, we discovered the unexpected presence of foreign genetic material in the nuclear genome of the allohexaploid grass Elymus repens (Pooideae-Triticeae) and some other Triticeae. Some ITS ribotypes as well as a small chromosomal segment corresponded to Panicum, a member of a different grass subfamily (Panicoideae-Paniceae). Their presence might be due to ancient introgression or horizontal gene transfer, or a combination of both. We plan to investigate the presence, nature, origin and evolutionary significance of the foreign genetic material in the Triticeae using various molecular and cytogenetic approaches. The foreign DNA in selected Triticeae will be separated and analysed for the presence of functional genes that will be compared with their homologs from Panicum. The different ribotypes in E. repens and other Triticeae will be quantified (Real-Time PCR) at the DNA and RNA level to study their functionality, dynamics, and expression patterns. The project will have a large impact on the understanding of processes and mechanisms occurring in plant genomes. (en)
- Během nedávné studii jsme objevili přítomnost cizorodého genetického materiálu v genomu alohexaploidního druhu trávy Elymus repens (pýr plazivý, Pooideae-Triticeae) a některých dalších zástupců Triticeae. Některé ITS ribotypy, a také malý chromozomový segment, odpovídaly druhu Panicum (proso) z jiné podčeledi trav (Panicoideae-Paniceae). Tento fakt může být důsledkem dávné introgrese nebo horizontálního přenosu, nebo kombinace obou procesů. Cílem projektu je zjistit přítomnost, charakter, původ, a evoluční význam cizorodého genetického materiálu v rámci Triticeae za použití rozličných molekulárních a cytogenetických technik. Cizorodá DNA u vybraných zástupců Triticeae bude separována a analyzována zejména na přítomnost funkčních genů, které budou porovnány s homology u prosa. Jednotlivé ribotypy u pýru a dalších Triticeae budou kvantifikovány pomocí Real-Time PCR na úrovni jak DNA, tak RNA, za účelem zjištění jejich funkčnosti, dynamiky a úrovni exprese. Navrhovaný projekt může významnou měrou přispět k pochopení procesů a mechanismů probíhajících v rostlinných genomech.
|
Title
| - Cizorodý genetický materiál v genomu Elymus repens a ostatních Triticeae: jeho charakteristika, původ a evoluční význam.
- Foreign genetic material in Elymus repens and other Triticeae grasses: its nature, origin, and evolutionary implications. (en)
|
skos:notation
| |
http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - Elymus repens, Triticeae, Panicum, introgression, ribosomal DNA, next generation sequencing, Real-Time PCR (en)
|
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - Panicum
- Triticeae
- introgression
- next generation sequencing
- ribosomal DNA
- Elymus repens
|
is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |