About: The role of hybridization and polyploidization on the evolution in Chenopodium album aggregate: From biosystematics to gene expression

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The role of hybridization and polyploidization on the evolution in Chenopodium album aggregate: From biosystematics to gene expression Goto Sponge Distinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-02290S
Description	The main delivery of the project is to provide unique insights to the evolutionary patterns of Euro Asiatic Chenopodium album agg. and the functional consequences of polyploidisation mediated duplication on floral development genes by studying the phylogenetic relationships among species and gene expression. Many species of diploid-polyploid complex of C. album evolved through hybridization and polyploidization events. However, different studies brought contradictory results most likely due to incomplete sampling design – the number of species studied is not sufficient. We will apply a combination of classical caryology for precise chromosome number determination, flow cytometry for ploidy level estimation, cpDNA for maternal parent determination and a nuclear markers derived from FTL genes that are capable in to identify parental genomes in various tetraploid and hexaploid taxa in C. album agg. The complex network of the taxa of various ploidy levels in C. album agg. provides an excellent opportunity to analyze possible gene function modification in various genomic context. (en) Hlavním cílem projektu je odhalit evoluční vztahy mezi euroasijskými zástupci agregátu Chenopodium album a ukázat funkční konsekvence polyploidizace na geny regulující kvetení. Velké množství druhů tohoto diploidně polyploidního komplexu vzniklo pomocí hybridizačních a polyploidizačních událostí. Nicméně, doposud publikované studie přináší rozporuplné výsledky, pravděpodobně zejména díky nedostatečnému počtu studovaných druhů. Předpokládáme užití kombinace několika metod, od klasické karyologie, přes průtokovou cytometrii pro determinaci stupně ploidie, chloroplastové DNA pro determinaci maternálních linií a jaderných markerů odvozených z FTL genů, pomocí nichž jsme schopni identifikovat rodičovské geonomy v různých polyploidních druzích agregátu C. album. Vyřešení původu jednotlivých polyploidních druhů pak umožní analyzovat různé funkční modifikace genů u jedinců s různým původem zodpovědných za regulaci kvetení u jedinců s různým původem.
Title	The role of hybridization and polyploidization on the evolution in Chenopodium album aggregate: From biosystematics to gene expression (en) Význam hybridizace a polyploidizace v evoluci Chenopodium album agg.: od biosystematiky ke genovým expresím
skos:notation	GA13-02290S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-02290S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-02290S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100769644
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EF - Botanika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Chenopodium, hybridization, polyploidization, evolution, gene expression (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Botanický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-23 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-02290S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2017-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Chenopodium evolution hybridization polyploidization
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2013/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2013/ico%3A67985939 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2014/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2014/ico%3A67985939 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2015/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2015/ico%3A67985939 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2016/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2016/ico%3A67985939 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2017/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-02290S/2017/ico%3A67985939

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software